Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rassf9Q8K342 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rassf9Q8K342 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rassf9Q8K342 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rassf9Q8K342 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rassf9Q8K342 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rassf9Q8K342 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rassf9Q8K342 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rassf9Q8K342 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rassf9Q8K342 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rassf9Q8K342 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rassf9Q8K342 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rassf9Q8K342 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rassf9Q8K342 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rassf9Q8K342 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rassf9Q8K342 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rassf9Q8K342 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rassf9Q8K342 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rassf9Q8K342 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rassf9Q8K342 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rassf9Q8K342 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rassf9Q8K342 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rassf9Q8K342 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rassf9Q8K342 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rassf9Q8K342 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rassf9Q8K342 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rassf9Q8K342 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rassf9Q8K342 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rassf9Q8K342 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rassf9Q8K342 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rassf9Q8K342 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rassf9Q8K342 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rassf9Q8K342 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rassf9Q8K342 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rassf9Q8K342 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rassf9Q8K342 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rassf9Q8K342 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rassf9Q8K342 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rassf9Q8K342 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rassf9Q8K342 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rassf9Q8K342 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rassf9Q8K342 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rassf9Q8K342 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rassf9Q8K342 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rassf9Q8K342 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rassf9Q8K342 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rassf9Q8K342 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rassf9Q8K342 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rassf9Q8K342 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rassf9Q8K342 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rassf9Q8K342 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rassf9Q8K342 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rassf9Q8K342 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rassf9Q8K342 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rassf9Q8K342 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rassf9Q8K342 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rassf9Q8K342 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rassf9Q8K342 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rassf9Q8K342 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rassf9Q8K342 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rassf9Q8K342 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rassf9Q8K342 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rassf9Q8K342 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rassf9Q8K342 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rassf9Q8K342 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rassf9Q8K342 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rassf9Q8K342 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rassf9Q8K342 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rassf9Q8K342 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rassf9Q8K342 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rassf9Q8K342 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rassf9Q8K342 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rassf9Q8K342 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rassf9Q8K342 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rassf9Q8K342 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rassf9Q8K342 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rassf9Q8K342 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rassf9Q8K342 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rassf9Q8K342 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rassf9Q8K342 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rassf9Q8K342 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rassf9Q8K342 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rassf9Q8K342 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rassf9Q8K342 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rassf9Q8K342 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rassf9Q8K342 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rassf9Q8K342 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rassf9Q8K342 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rassf9Q8K342 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rassf9Q8K342 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rassf9Q8K342 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rassf9Q8K342 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rassf9Q8K342 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rassf9Q8K342 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rassf9Q8K342 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rassf9Q8K342 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rassf9Q8K342 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rassf9Q8K342 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rassf9Q8K342 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rassf9Q8K342 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms