Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q7

Brox, BRO1 domain-containing protein BROX, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BroxQ8K2Q7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BroxQ8K2Q7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BroxQ8K2Q7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BroxQ8K2Q7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BroxQ8K2Q7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BroxQ8K2Q7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BroxQ8K2Q7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
BroxQ8K2Q7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BroxQ8K2Q7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BroxQ8K2Q7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BroxQ8K2Q7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BroxQ8K2Q7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BroxQ8K2Q7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BroxQ8K2Q7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BroxQ8K2Q7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BroxQ8K2Q7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BroxQ8K2Q7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BroxQ8K2Q7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BroxQ8K2Q7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BroxQ8K2Q7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BroxQ8K2Q7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BroxQ8K2Q7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BroxQ8K2Q7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BroxQ8K2Q7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BroxQ8K2Q7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BroxQ8K2Q7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BroxQ8K2Q7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BroxQ8K2Q7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BroxQ8K2Q7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BroxQ8K2Q7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BroxQ8K2Q7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BroxQ8K2Q7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BroxQ8K2Q7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BroxQ8K2Q7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BroxQ8K2Q7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BroxQ8K2Q7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BroxQ8K2Q7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BroxQ8K2Q7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BroxQ8K2Q7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BroxQ8K2Q7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BroxQ8K2Q7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BroxQ8K2Q7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BroxQ8K2Q7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BroxQ8K2Q7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BroxQ8K2Q7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BroxQ8K2Q7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BroxQ8K2Q7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BroxQ8K2Q7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BroxQ8K2Q7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BroxQ8K2Q7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BroxQ8K2Q7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BroxQ8K2Q7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BroxQ8K2Q7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BroxQ8K2Q7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BroxQ8K2Q7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BroxQ8K2Q7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BroxQ8K2Q7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BroxQ8K2Q7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BroxQ8K2Q7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BroxQ8K2Q7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BroxQ8K2Q7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BroxQ8K2Q7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BroxQ8K2Q7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BroxQ8K2Q7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BroxQ8K2Q7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BroxQ8K2Q7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BroxQ8K2Q7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms