Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mtmr3Q8K296 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mtmr3Q8K296 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mtmr3Q8K296 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mtmr3Q8K296 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mtmr3Q8K296 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mtmr3Q8K296 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Mtmr3Q8K296 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mtmr3Q8K296 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mtmr3Q8K296 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mtmr3Q8K296 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mtmr3Q8K296 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mtmr3Q8K296 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mtmr3Q8K296 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mtmr3Q8K296 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mtmr3Q8K296 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mtmr3Q8K296 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mtmr3Q8K296 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mtmr3Q8K296 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mtmr3Q8K296 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mtmr3Q8K296 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mtmr3Q8K296 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mtmr3Q8K296 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mtmr3Q8K296 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mtmr3Q8K296 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mtmr3Q8K296 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mtmr3Q8K296 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mtmr3Q8K296 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mtmr3Q8K296 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mtmr3Q8K296 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mtmr3Q8K296 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mtmr3Q8K296 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mtmr3Q8K296 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mtmr3Q8K296 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mtmr3Q8K296 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mtmr3Q8K296 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mtmr3Q8K296 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Mtmr3Q8K296 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mtmr3Q8K296 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mtmr3Q8K296 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mtmr3Q8K296 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mtmr3Q8K296 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mtmr3Q8K296 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mtmr3Q8K296 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mtmr3Q8K296 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mtmr3Q8K296 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mtmr3Q8K296 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mtmr3Q8K296 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mtmr3Q8K296 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mtmr3Q8K296 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mtmr3Q8K296 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mtmr3Q8K296 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mtmr3Q8K296 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mtmr3Q8K296 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mtmr3Q8K296 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mtmr3Q8K296 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mtmr3Q8K296 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mtmr3Q8K296 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Mtmr3Q8K296 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
Mtmr3Q8K296 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mtmr3Q8K296 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mtmr3Q8K296 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mtmr3Q8K296 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mtmr3Q8K296 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mtmr3Q8K296 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mtmr3Q8K296 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mtmr3Q8K296 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mtmr3Q8K296 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mtmr3Q8K296 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mtmr3Q8K296 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mtmr3Q8K296 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mtmr3Q8K296 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mtmr3Q8K296 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mtmr3Q8K296 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Mtmr3Q8K296 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mtmr3Q8K296 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mtmr3Q8K296 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mtmr3Q8K296 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mtmr3Q8K296 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mtmr3Q8K296 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mtmr3Q8K296 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mtmr3Q8K296 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mtmr3Q8K296 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mtmr3Q8K296 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mtmr3Q8K296 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mtmr3Q8K296 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mtmr3Q8K296 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mtmr3Q8K296 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mtmr3Q8K296 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mtmr3Q8K296 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mtmr3Q8K296 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mtmr3Q8K296 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mtmr3Q8K296 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mtmr3Q8K296 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mtmr3Q8K296 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mtmr3Q8K296 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mtmr3Q8K296 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mtmr3Q8K296 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mtmr3Q8K296 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mtmr3Q8K296 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms