Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FgbQ8K0E8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FgbQ8K0E8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FgbQ8K0E8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FgbQ8K0E8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FgbQ8K0E8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FgbQ8K0E8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FgbQ8K0E8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FgbQ8K0E8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FgbQ8K0E8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FgbQ8K0E8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FgbQ8K0E8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FgbQ8K0E8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FgbQ8K0E8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FgbQ8K0E8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FgbQ8K0E8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FgbQ8K0E8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FgbQ8K0E8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FgbQ8K0E8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FgbQ8K0E8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FgbQ8K0E8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FgbQ8K0E8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FgbQ8K0E8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FgbQ8K0E8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FgbQ8K0E8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FgbQ8K0E8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FgbQ8K0E8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FgbQ8K0E8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FgbQ8K0E8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FgbQ8K0E8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FgbQ8K0E8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FgbQ8K0E8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FgbQ8K0E8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FgbQ8K0E8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FgbQ8K0E8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FgbQ8K0E8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FgbQ8K0E8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FgbQ8K0E8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FgbQ8K0E8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FgbQ8K0E8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FgbQ8K0E8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FgbQ8K0E8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FgbQ8K0E8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FgbQ8K0E8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FgbQ8K0E8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FgbQ8K0E8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FgbQ8K0E8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FgbQ8K0E8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FgbQ8K0E8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FgbQ8K0E8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FgbQ8K0E8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FgbQ8K0E8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FgbQ8K0E8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FgbQ8K0E8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FgbQ8K0E8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FgbQ8K0E8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FgbQ8K0E8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FgbQ8K0E8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FgbQ8K0E8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FgbQ8K0E8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FgbQ8K0E8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FgbQ8K0E8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FgbQ8K0E8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FgbQ8K0E8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FgbQ8K0E8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FgbQ8K0E8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FgbQ8K0E8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FgbQ8K0E8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FgbQ8K0E8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FgbQ8K0E8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FgbQ8K0E8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FgbQ8K0E8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FgbQ8K0E8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FgbQ8K0E8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms