Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm17Q8JZX4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rbm17Q8JZX4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rbm17Q8JZX4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rbm17Q8JZX4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rbm17Q8JZX4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rbm17Q8JZX4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rbm17Q8JZX4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rbm17Q8JZX4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rbm17Q8JZX4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rbm17Q8JZX4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rbm17Q8JZX4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Rbm17Q8JZX4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rbm17Q8JZX4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rbm17Q8JZX4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rbm17Q8JZX4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rbm17Q8JZX4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rbm17Q8JZX4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rbm17Q8JZX4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rbm17Q8JZX4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rbm17Q8JZX4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rbm17Q8JZX4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rbm17Q8JZX4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Rbm17Q8JZX4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Rbm17Q8JZX4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Rbm17Q8JZX4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Rbm17Q8JZX4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rbm17Q8JZX4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rbm17Q8JZX4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rbm17Q8JZX4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rbm17Q8JZX4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rbm17Q8JZX4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rbm17Q8JZX4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Rbm17Q8JZX4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rbm17Q8JZX4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rbm17Q8JZX4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rbm17Q8JZX4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rbm17Q8JZX4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rbm17Q8JZX4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rbm17Q8JZX4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rbm17Q8JZX4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rbm17Q8JZX4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rbm17Q8JZX4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rbm17Q8JZX4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rbm17Q8JZX4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rbm17Q8JZX4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rbm17Q8JZX4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rbm17Q8JZX4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rbm17Q8JZX4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rbm17Q8JZX4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rbm17Q8JZX4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rbm17Q8JZX4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rbm17Q8JZX4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rbm17Q8JZX4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rbm17Q8JZX4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rbm17Q8JZX4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rbm17Q8JZX4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rbm17Q8JZX4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rbm17Q8JZX4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rbm17Q8JZX4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rbm17Q8JZX4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rbm17Q8JZX4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rbm17Q8JZX4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rbm17Q8JZX4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rbm17Q8JZX4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rbm17Q8JZX4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rbm17Q8JZX4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Rbm17Q8JZX4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rbm17Q8JZX4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rbm17Q8JZX4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rbm17Q8JZX4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rbm17Q8JZX4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rbm17Q8JZX4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rbm17Q8JZX4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rbm17Q8JZX4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rbm17Q8JZX4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rbm17Q8JZX4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Rbm17Q8JZX4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rbm17Q8JZX4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Rbm17Q8JZX4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rbm17Q8JZX4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rbm17Q8JZX4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rbm17Q8JZX4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rbm17Q8JZX4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rbm17Q8JZX4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rbm17Q8JZX4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rbm17Q8JZX4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Rbm17Q8JZX4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rbm17Q8JZX4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rbm17Q8JZX4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rbm17Q8JZX4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rbm17Q8JZX4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rbm17Q8JZX4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rbm17Q8JZX4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rbm17Q8JZX4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Rbm17Q8JZX4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rbm17Q8JZX4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Rbm17Q8JZX4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rbm17Q8JZX4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rbm17Q8JZX4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rbm17Q8JZX4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms