Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF6

Wdr47, WD repeat-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 920 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr47Q8CGF6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdr47Q8CGF6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdr47Q8CGF6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Wdr47Q8CGF6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdr47Q8CGF6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdr47Q8CGF6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdr47Q8CGF6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdr47Q8CGF6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdr47Q8CGF6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdr47Q8CGF6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdr47Q8CGF6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdr47Q8CGF6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdr47Q8CGF6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Wdr47Q8CGF6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdr47Q8CGF6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdr47Q8CGF6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdr47Q8CGF6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdr47Q8CGF6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdr47Q8CGF6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdr47Q8CGF6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdr47Q8CGF6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdr47Q8CGF6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdr47Q8CGF6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdr47Q8CGF6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdr47Q8CGF6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Wdr47Q8CGF6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdr47Q8CGF6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdr47Q8CGF6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdr47Q8CGF6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wdr47Q8CGF6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wdr47Q8CGF6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wdr47Q8CGF6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Wdr47Q8CGF6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Wdr47Q8CGF6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Wdr47Q8CGF6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Wdr47Q8CGF6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Wdr47Q8CGF6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Wdr47Q8CGF6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Wdr47Q8CGF6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Wdr47Q8CGF6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Wdr47Q8CGF6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Wdr47Q8CGF6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Wdr47Q8CGF6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Wdr47Q8CGF6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Wdr47Q8CGF6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Wdr47Q8CGF6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Wdr47Q8CGF6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Wdr47Q8CGF6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Wdr47Q8CGF6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr47Q8CGF6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr47Q8CGF6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr47Q8CGF6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr47Q8CGF6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr47Q8CGF6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr47Q8CGF6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr47Q8CGF6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr47Q8CGF6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr47Q8CGF6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr47Q8CGF6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr47Q8CGF6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr47Q8CGF6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr47Q8CGF6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr47Q8CGF6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr47Q8CGF6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr47Q8CGF6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr47Q8CGF6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr47Q8CGF6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr47Q8CGF6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr47Q8CGF6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr47Q8CGF6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr47Q8CGF6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr47Q8CGF6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr47Q8CGF6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr47Q8CGF6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr47Q8CGF6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr47Q8CGF6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr47Q8CGF6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr47Q8CGF6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr47Q8CGF6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr47Q8CGF6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr47Q8CGF6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr47Q8CGF6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr47Q8CGF6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr47Q8CGF6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr47Q8CGF6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr47Q8CGF6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr47Q8CGF6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr47Q8CGF6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr47Q8CGF6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr47Q8CGF6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr47Q8CGF6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr47Q8CGF6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr47Q8CGF6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr47Q8CGF6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr47Q8CGF6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr47Q8CGF6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr47Q8CGF6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr47Q8CGF6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr47Q8CGF6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr47Q8CGF6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms