Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arhgap29Q8CGF1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arhgap29Q8CGF1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arhgap29Q8CGF1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arhgap29Q8CGF1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arhgap29Q8CGF1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arhgap29Q8CGF1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arhgap29Q8CGF1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arhgap29Q8CGF1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arhgap29Q8CGF1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arhgap29Q8CGF1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arhgap29Q8CGF1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arhgap29Q8CGF1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arhgap29Q8CGF1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arhgap29Q8CGF1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arhgap29Q8CGF1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arhgap29Q8CGF1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arhgap29Q8CGF1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arhgap29Q8CGF1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgap29Q8CGF1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgap29Q8CGF1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arhgap29Q8CGF1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arhgap29Q8CGF1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arhgap29Q8CGF1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arhgap29Q8CGF1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arhgap29Q8CGF1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arhgap29Q8CGF1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arhgap29Q8CGF1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arhgap29Q8CGF1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arhgap29Q8CGF1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arhgap29Q8CGF1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arhgap29Q8CGF1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arhgap29Q8CGF1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arhgap29Q8CGF1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arhgap29Q8CGF1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arhgap29Q8CGF1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arhgap29Q8CGF1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arhgap29Q8CGF1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Arhgap29Q8CGF1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arhgap29Q8CGF1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arhgap29Q8CGF1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arhgap29Q8CGF1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arhgap29Q8CGF1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arhgap29Q8CGF1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arhgap29Q8CGF1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arhgap29Q8CGF1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arhgap29Q8CGF1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arhgap29Q8CGF1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arhgap29Q8CGF1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arhgap29Q8CGF1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arhgap29Q8CGF1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arhgap29Q8CGF1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arhgap29Q8CGF1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arhgap29Q8CGF1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arhgap29Q8CGF1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arhgap29Q8CGF1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arhgap29Q8CGF1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arhgap29Q8CGF1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arhgap29Q8CGF1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Arhgap29Q8CGF1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arhgap29Q8CGF1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arhgap29Q8CGF1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arhgap29Q8CGF1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap29Q8CGF1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap29Q8CGF1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap29Q8CGF1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap29Q8CGF1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap29Q8CGF1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap29Q8CGF1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap29Q8CGF1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap29Q8CGF1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms