Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG50

Rab43, Ras-related protein Rab-43, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab43Q8CG50 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab43Q8CG50 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab43Q8CG50 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab43Q8CG50 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab43Q8CG50 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rab43Q8CG50 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab43Q8CG50 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab43Q8CG50 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab43Q8CG50 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab43Q8CG50 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab43Q8CG50 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab43Q8CG50 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab43Q8CG50 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab43Q8CG50 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab43Q8CG50 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab43Q8CG50 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab43Q8CG50 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab43Q8CG50 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab43Q8CG50 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab43Q8CG50 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab43Q8CG50 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab43Q8CG50 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab43Q8CG50 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab43Q8CG50 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab43Q8CG50 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab43Q8CG50 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab43Q8CG50 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab43Q8CG50 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab43Q8CG50 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab43Q8CG50 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab43Q8CG50 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab43Q8CG50 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab43Q8CG50 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab43Q8CG50 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab43Q8CG50 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab43Q8CG50 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab43Q8CG50 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab43Q8CG50 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab43Q8CG50 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab43Q8CG50 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab43Q8CG50 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab43Q8CG50 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab43Q8CG50 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab43Q8CG50 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab43Q8CG50 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab43Q8CG50 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab43Q8CG50 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab43Q8CG50 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab43Q8CG50 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab43Q8CG50 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab43Q8CG50 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab43Q8CG50 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab43Q8CG50 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab43Q8CG50 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab43Q8CG50 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab43Q8CG50 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab43Q8CG50 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab43Q8CG50 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab43Q8CG50 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab43Q8CG50 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab43Q8CG50 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab43Q8CG50 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rab43Q8CG50 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab43Q8CG50 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab43Q8CG50 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab43Q8CG50 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab43Q8CG50 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab43Q8CG50 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab43Q8CG50 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab43Q8CG50 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab43Q8CG50 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms