Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Brf1Q8CFK2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Brf1Q8CFK2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Brf1Q8CFK2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Brf1Q8CFK2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Brf1Q8CFK2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Brf1Q8CFK2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Brf1Q8CFK2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Brf1Q8CFK2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Brf1Q8CFK2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Brf1Q8CFK2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Brf1Q8CFK2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Brf1Q8CFK2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Brf1Q8CFK2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Brf1Q8CFK2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brf1Q8CFK2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brf1Q8CFK2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brf1Q8CFK2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brf1Q8CFK2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Brf1Q8CFK2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Brf1Q8CFK2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Brf1Q8CFK2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Brf1Q8CFK2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Brf1Q8CFK2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brf1Q8CFK2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brf1Q8CFK2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brf1Q8CFK2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brf1Q8CFK2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brf1Q8CFK2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brf1Q8CFK2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Brf1Q8CFK2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Brf1Q8CFK2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brf1Q8CFK2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brf1Q8CFK2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brf1Q8CFK2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brf1Q8CFK2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brf1Q8CFK2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brf1Q8CFK2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brf1Q8CFK2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brf1Q8CFK2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Brf1Q8CFK2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Brf1Q8CFK2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Brf1Q8CFK2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Brf1Q8CFK2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Brf1Q8CFK2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Brf1Q8CFK2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Brf1Q8CFK2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Brf1Q8CFK2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Brf1Q8CFK2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Brf1Q8CFK2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Brf1Q8CFK2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Brf1Q8CFK2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Brf1Q8CFK2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Brf1Q8CFK2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Brf1Q8CFK2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Brf1Q8CFK2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Brf1Q8CFK2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Brf1Q8CFK2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Brf1Q8CFK2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Brf1Q8CFK2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Brf1Q8CFK2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Brf1Q8CFK2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Brf1Q8CFK2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Brf1Q8CFK2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Brf1Q8CFK2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Brf1Q8CFK2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Brf1Q8CFK2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Brf1Q8CFK2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Brf1Q8CFK2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Brf1Q8CFK2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Brf1Q8CFK2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Brf1Q8CFK2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Brf1Q8CFK2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Brf1Q8CFK2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Brf1Q8CFK2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Brf1Q8CFK2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Brf1Q8CFK2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Brf1Q8CFK2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Brf1Q8CFK2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Brf1Q8CFK2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Brf1Q8CFK2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Brf1Q8CFK2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Brf1Q8CFK2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Brf1Q8CFK2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brf1Q8CFK2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brf1Q8CFK2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brf1Q8CFK2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Brf1Q8CFK2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Brf1Q8CFK2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Brf1Q8CFK2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Brf1Q8CFK2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Brf1Q8CFK2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Brf1Q8CFK2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Brf1Q8CFK2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Brf1Q8CFK2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Brf1Q8CFK2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Brf1Q8CFK2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Brf1Q8CFK2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Brf1Q8CFK2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Brf1Q8CFK2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms