Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx8Q8CFD4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx8Q8CFD4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx8Q8CFD4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx8Q8CFD4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx8Q8CFD4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx8Q8CFD4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx8Q8CFD4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx8Q8CFD4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx8Q8CFD4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx8Q8CFD4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx8Q8CFD4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx8Q8CFD4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx8Q8CFD4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx8Q8CFD4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx8Q8CFD4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx8Q8CFD4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx8Q8CFD4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx8Q8CFD4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx8Q8CFD4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx8Q8CFD4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx8Q8CFD4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx8Q8CFD4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx8Q8CFD4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx8Q8CFD4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx8Q8CFD4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx8Q8CFD4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx8Q8CFD4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx8Q8CFD4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx8Q8CFD4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx8Q8CFD4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx8Q8CFD4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx8Q8CFD4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx8Q8CFD4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx8Q8CFD4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx8Q8CFD4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx8Q8CFD4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx8Q8CFD4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx8Q8CFD4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx8Q8CFD4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx8Q8CFD4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx8Q8CFD4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx8Q8CFD4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx8Q8CFD4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx8Q8CFD4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx8Q8CFD4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx8Q8CFD4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx8Q8CFD4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx8Q8CFD4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx8Q8CFD4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx8Q8CFD4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx8Q8CFD4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx8Q8CFD4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx8Q8CFD4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx8Q8CFD4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx8Q8CFD4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx8Q8CFD4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx8Q8CFD4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx8Q8CFD4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx8Q8CFD4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx8Q8CFD4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx8Q8CFD4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx8Q8CFD4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx8Q8CFD4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx8Q8CFD4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx8Q8CFD4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx8Q8CFD4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx8Q8CFD4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx8Q8CFD4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx8Q8CFD4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx8Q8CFD4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx8Q8CFD4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx8Q8CFD4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx8Q8CFD4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx8Q8CFD4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx8Q8CFD4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx8Q8CFD4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx8Q8CFD4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx8Q8CFD4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx8Q8CFD4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx8Q8CFD4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx8Q8CFD4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx8Q8CFD4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx8Q8CFD4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx8Q8CFD4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx8Q8CFD4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx8Q8CFD4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx8Q8CFD4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx8Q8CFD4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx8Q8CFD4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx8Q8CFD4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx8Q8CFD4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx8Q8CFD4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx8Q8CFD4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx8Q8CFD4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx8Q8CFD4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx8Q8CFD4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx8Q8CFD4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx8Q8CFD4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx8Q8CFD4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms