Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ9

4932414N04Rik, RIKEN cDNA 4932414N04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4932414N04RikQ8CEQ9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4932414N04RikQ8CEQ9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4932414N04RikQ8CEQ9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4932414N04RikQ8CEQ9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4932414N04RikQ8CEQ9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4932414N04RikQ8CEQ9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4932414N04RikQ8CEQ9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4932414N04RikQ8CEQ9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4932414N04RikQ8CEQ9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4932414N04RikQ8CEQ9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4932414N04RikQ8CEQ9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4932414N04RikQ8CEQ9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4932414N04RikQ8CEQ9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
4932414N04RikQ8CEQ9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4932414N04RikQ8CEQ9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4932414N04RikQ8CEQ9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4932414N04RikQ8CEQ9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4932414N04RikQ8CEQ9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4932414N04RikQ8CEQ9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4932414N04RikQ8CEQ9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
4932414N04RikQ8CEQ9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4932414N04RikQ8CEQ9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4932414N04RikQ8CEQ9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
4932414N04RikQ8CEQ9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4932414N04RikQ8CEQ9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4932414N04RikQ8CEQ9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4932414N04RikQ8CEQ9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4932414N04RikQ8CEQ9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4932414N04RikQ8CEQ9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4932414N04RikQ8CEQ9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4932414N04RikQ8CEQ9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4932414N04RikQ8CEQ9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4932414N04RikQ8CEQ9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4932414N04RikQ8CEQ9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4932414N04RikQ8CEQ9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4932414N04RikQ8CEQ9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4932414N04RikQ8CEQ9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
4932414N04RikQ8CEQ9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4932414N04RikQ8CEQ9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4932414N04RikQ8CEQ9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4932414N04RikQ8CEQ9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4932414N04RikQ8CEQ9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4932414N04RikQ8CEQ9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4932414N04RikQ8CEQ9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4932414N04RikQ8CEQ9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4932414N04RikQ8CEQ9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4932414N04RikQ8CEQ9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4932414N04RikQ8CEQ9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4932414N04RikQ8CEQ9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4932414N04RikQ8CEQ9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4932414N04RikQ8CEQ9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4932414N04RikQ8CEQ9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4932414N04RikQ8CEQ9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4932414N04RikQ8CEQ9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4932414N04RikQ8CEQ9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4932414N04RikQ8CEQ9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4932414N04RikQ8CEQ9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4932414N04RikQ8CEQ9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4932414N04RikQ8CEQ9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4932414N04RikQ8CEQ9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4932414N04RikQ8CEQ9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4932414N04RikQ8CEQ9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4932414N04RikQ8CEQ9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4932414N04RikQ8CEQ9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4932414N04RikQ8CEQ9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4932414N04RikQ8CEQ9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4932414N04RikQ8CEQ9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms