Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc159Q8C963 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc159Q8C963 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc159Q8C963 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc159Q8C963 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc159Q8C963 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc159Q8C963 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc159Q8C963 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc159Q8C963 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc159Q8C963 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc159Q8C963 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc159Q8C963 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc159Q8C963 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc159Q8C963 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc159Q8C963 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc159Q8C963 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc159Q8C963 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc159Q8C963 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc159Q8C963 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc159Q8C963 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc159Q8C963 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc159Q8C963 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc159Q8C963 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc159Q8C963 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc159Q8C963 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc159Q8C963 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc159Q8C963 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc159Q8C963 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc159Q8C963 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc159Q8C963 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc159Q8C963 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc159Q8C963 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc159Q8C963 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc159Q8C963 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc159Q8C963 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc159Q8C963 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc159Q8C963 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc159Q8C963 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc159Q8C963 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc159Q8C963 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc159Q8C963 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc159Q8C963 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc159Q8C963 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc159Q8C963 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc159Q8C963 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc159Q8C963 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc159Q8C963 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc159Q8C963 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc159Q8C963 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc159Q8C963 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc159Q8C963 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc159Q8C963 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc159Q8C963 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc159Q8C963 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc159Q8C963 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc159Q8C963 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc159Q8C963 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc159Q8C963 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc159Q8C963 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc159Q8C963 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc159Q8C963 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc159Q8C963 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc159Q8C963 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc159Q8C963 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc159Q8C963 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc159Q8C963 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc159Q8C963 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc159Q8C963 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc159Q8C963 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc159Q8C963 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc159Q8C963 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc159Q8C963 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc159Q8C963 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc159Q8C963 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc159Q8C963 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc159Q8C963 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc159Q8C963 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc159Q8C963 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc159Q8C963 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc159Q8C963 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc159Q8C963 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc159Q8C963 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc159Q8C963 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc159Q8C963 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc159Q8C963 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc159Q8C963 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc159Q8C963 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc159Q8C963 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc159Q8C963 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc159Q8C963 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc159Q8C963 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc159Q8C963 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc159Q8C963 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc159Q8C963 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc159Q8C963 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc159Q8C963 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc159Q8C963 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc159Q8C963 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc159Q8C963 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc159Q8C963 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125 ms