Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apol7cQ8C6E1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Apol7cQ8C6E1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apol7cQ8C6E1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apol7cQ8C6E1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apol7cQ8C6E1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apol7cQ8C6E1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apol7cQ8C6E1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apol7cQ8C6E1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apol7cQ8C6E1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Apol7cQ8C6E1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apol7cQ8C6E1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apol7cQ8C6E1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apol7cQ8C6E1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apol7cQ8C6E1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apol7cQ8C6E1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Apol7cQ8C6E1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Apol7cQ8C6E1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apol7cQ8C6E1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apol7cQ8C6E1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apol7cQ8C6E1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apol7cQ8C6E1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apol7cQ8C6E1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Apol7cQ8C6E1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apol7cQ8C6E1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apol7cQ8C6E1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apol7cQ8C6E1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apol7cQ8C6E1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apol7cQ8C6E1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apol7cQ8C6E1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apol7cQ8C6E1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apol7cQ8C6E1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apol7cQ8C6E1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apol7cQ8C6E1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apol7cQ8C6E1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apol7cQ8C6E1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Apol7cQ8C6E1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apol7cQ8C6E1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apol7cQ8C6E1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apol7cQ8C6E1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apol7cQ8C6E1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apol7cQ8C6E1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apol7cQ8C6E1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apol7cQ8C6E1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apol7cQ8C6E1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Apol7cQ8C6E1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apol7cQ8C6E1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apol7cQ8C6E1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apol7cQ8C6E1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apol7cQ8C6E1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apol7cQ8C6E1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apol7cQ8C6E1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apol7cQ8C6E1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apol7cQ8C6E1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apol7cQ8C6E1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Apol7cQ8C6E1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Apol7cQ8C6E1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apol7cQ8C6E1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apol7cQ8C6E1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apol7cQ8C6E1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apol7cQ8C6E1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apol7cQ8C6E1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apol7cQ8C6E1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apol7cQ8C6E1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apol7cQ8C6E1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apol7cQ8C6E1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apol7cQ8C6E1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apol7cQ8C6E1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Apol7cQ8C6E1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apol7cQ8C6E1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apol7cQ8C6E1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apol7cQ8C6E1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Apol7cQ8C6E1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apol7cQ8C6E1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apol7cQ8C6E1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apol7cQ8C6E1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms