Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ClmnQ8C5W0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ClmnQ8C5W0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ClmnQ8C5W0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ClmnQ8C5W0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ClmnQ8C5W0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ClmnQ8C5W0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ClmnQ8C5W0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ClmnQ8C5W0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ClmnQ8C5W0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ClmnQ8C5W0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ClmnQ8C5W0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ClmnQ8C5W0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ClmnQ8C5W0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ClmnQ8C5W0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ClmnQ8C5W0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ClmnQ8C5W0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ClmnQ8C5W0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ClmnQ8C5W0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ClmnQ8C5W0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ClmnQ8C5W0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ClmnQ8C5W0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ClmnQ8C5W0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ClmnQ8C5W0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ClmnQ8C5W0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ClmnQ8C5W0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ClmnQ8C5W0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ClmnQ8C5W0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ClmnQ8C5W0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ClmnQ8C5W0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ClmnQ8C5W0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ClmnQ8C5W0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ClmnQ8C5W0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ClmnQ8C5W0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ClmnQ8C5W0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ClmnQ8C5W0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ClmnQ8C5W0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ClmnQ8C5W0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ClmnQ8C5W0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ClmnQ8C5W0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ClmnQ8C5W0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ClmnQ8C5W0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ClmnQ8C5W0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ClmnQ8C5W0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ClmnQ8C5W0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ClmnQ8C5W0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ClmnQ8C5W0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ClmnQ8C5W0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ClmnQ8C5W0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ClmnQ8C5W0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ClmnQ8C5W0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ClmnQ8C5W0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ClmnQ8C5W0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ClmnQ8C5W0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ClmnQ8C5W0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ClmnQ8C5W0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ClmnQ8C5W0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ClmnQ8C5W0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ClmnQ8C5W0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ClmnQ8C5W0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ClmnQ8C5W0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ClmnQ8C5W0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ClmnQ8C5W0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ClmnQ8C5W0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ClmnQ8C5W0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ClmnQ8C5W0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ClmnQ8C5W0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ClmnQ8C5W0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ClmnQ8C5W0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ClmnQ8C5W0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ClmnQ8C5W0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms