Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
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4933409G03RikQ8C5U0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4933409G03RikQ8C5U0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4933409G03RikQ8C5U0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4933409G03RikQ8C5U0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
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4933409G03RikQ8C5U0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
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4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
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4933409G03RikQ8C5U0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4933409G03RikQ8C5U0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
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4933409G03RikQ8C5U0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
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4933409G03RikQ8C5U0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4933409G03RikQ8C5U0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4933409G03RikQ8C5U0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4933409G03RikQ8C5U0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4933409G03RikQ8C5U0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
4933409G03RikQ8C5U0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4933409G03RikQ8C5U0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4933409G03RikQ8C5U0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4933409G03RikQ8C5U0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4933409G03RikQ8C5U0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4933409G03RikQ8C5U0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
4933409G03RikQ8C5U0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
4933409G03RikQ8C5U0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4933409G03RikQ8C5U0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4933409G03RikQ8C5U0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4933409G03RikQ8C5U0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
4933409G03RikQ8C5U0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
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