Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc113Q8C5T8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc113Q8C5T8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc113Q8C5T8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc113Q8C5T8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc113Q8C5T8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc113Q8C5T8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc113Q8C5T8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc113Q8C5T8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc113Q8C5T8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc113Q8C5T8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc113Q8C5T8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc113Q8C5T8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc113Q8C5T8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc113Q8C5T8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc113Q8C5T8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc113Q8C5T8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc113Q8C5T8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc113Q8C5T8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc113Q8C5T8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc113Q8C5T8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc113Q8C5T8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc113Q8C5T8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc113Q8C5T8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc113Q8C5T8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc113Q8C5T8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ccdc113Q8C5T8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ccdc113Q8C5T8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ccdc113Q8C5T8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc113Q8C5T8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc113Q8C5T8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc113Q8C5T8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc113Q8C5T8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc113Q8C5T8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc113Q8C5T8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc113Q8C5T8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc113Q8C5T8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc113Q8C5T8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc113Q8C5T8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc113Q8C5T8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc113Q8C5T8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc113Q8C5T8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc113Q8C5T8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc113Q8C5T8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc113Q8C5T8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc113Q8C5T8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc113Q8C5T8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc113Q8C5T8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc113Q8C5T8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc113Q8C5T8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc113Q8C5T8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc113Q8C5T8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc113Q8C5T8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc113Q8C5T8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc113Q8C5T8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc113Q8C5T8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc113Q8C5T8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc113Q8C5T8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc113Q8C5T8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc113Q8C5T8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc113Q8C5T8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc113Q8C5T8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc113Q8C5T8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc113Q8C5T8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc113Q8C5T8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc113Q8C5T8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc113Q8C5T8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc113Q8C5T8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc113Q8C5T8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc113Q8C5T8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc113Q8C5T8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc113Q8C5T8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc113Q8C5T8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc113Q8C5T8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc113Q8C5T8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc113Q8C5T8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc113Q8C5T8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc113Q8C5T8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc113Q8C5T8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc113Q8C5T8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc113Q8C5T8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc113Q8C5T8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc113Q8C5T8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc113Q8C5T8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc113Q8C5T8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc113Q8C5T8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc113Q8C5T8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc113Q8C5T8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc113Q8C5T8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc113Q8C5T8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc113Q8C5T8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc113Q8C5T8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc113Q8C5T8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc113Q8C5T8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc113Q8C5T8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc113Q8C5T8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc113Q8C5T8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc113Q8C5T8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc113Q8C5T8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
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