Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim35Q8C006 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim35Q8C006 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim35Q8C006 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim35Q8C006 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim35Q8C006 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim35Q8C006 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim35Q8C006 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim35Q8C006 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim35Q8C006 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim35Q8C006 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim35Q8C006 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim35Q8C006 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim35Q8C006 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim35Q8C006 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim35Q8C006 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim35Q8C006 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim35Q8C006 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim35Q8C006 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim35Q8C006 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim35Q8C006 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim35Q8C006 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim35Q8C006 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim35Q8C006 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim35Q8C006 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim35Q8C006 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim35Q8C006 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim35Q8C006 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim35Q8C006 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim35Q8C006 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim35Q8C006 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim35Q8C006 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim35Q8C006 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim35Q8C006 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim35Q8C006 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim35Q8C006 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim35Q8C006 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim35Q8C006 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim35Q8C006 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim35Q8C006 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim35Q8C006 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim35Q8C006 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim35Q8C006 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim35Q8C006 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim35Q8C006 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim35Q8C006 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim35Q8C006 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim35Q8C006 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim35Q8C006 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim35Q8C006 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim35Q8C006 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim35Q8C006 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim35Q8C006 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim35Q8C006 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim35Q8C006 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim35Q8C006 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim35Q8C006 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim35Q8C006 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim35Q8C006 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim35Q8C006 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim35Q8C006 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim35Q8C006 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim35Q8C006 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim35Q8C006 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim35Q8C006 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim35Q8C006 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim35Q8C006 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim35Q8C006 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim35Q8C006 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim35Q8C006 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim35Q8C006 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.8 ms