Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXN7

Ppm1k, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1kQ8BXN7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppm1kQ8BXN7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppm1kQ8BXN7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppm1kQ8BXN7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppm1kQ8BXN7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppm1kQ8BXN7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppm1kQ8BXN7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppm1kQ8BXN7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppm1kQ8BXN7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppm1kQ8BXN7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppm1kQ8BXN7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppm1kQ8BXN7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppm1kQ8BXN7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppm1kQ8BXN7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppm1kQ8BXN7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppm1kQ8BXN7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppm1kQ8BXN7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppm1kQ8BXN7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppm1kQ8BXN7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppm1kQ8BXN7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppm1kQ8BXN7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppm1kQ8BXN7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppm1kQ8BXN7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppm1kQ8BXN7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppm1kQ8BXN7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppm1kQ8BXN7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppm1kQ8BXN7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppm1kQ8BXN7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppm1kQ8BXN7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppm1kQ8BXN7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppm1kQ8BXN7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppm1kQ8BXN7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppm1kQ8BXN7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppm1kQ8BXN7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppm1kQ8BXN7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppm1kQ8BXN7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppm1kQ8BXN7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppm1kQ8BXN7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppm1kQ8BXN7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppm1kQ8BXN7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppm1kQ8BXN7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppm1kQ8BXN7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppm1kQ8BXN7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppm1kQ8BXN7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppm1kQ8BXN7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppm1kQ8BXN7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppm1kQ8BXN7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppm1kQ8BXN7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppm1kQ8BXN7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppm1kQ8BXN7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppm1kQ8BXN7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppm1kQ8BXN7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppm1kQ8BXN7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppm1kQ8BXN7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppm1kQ8BXN7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppm1kQ8BXN7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppm1kQ8BXN7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppm1kQ8BXN7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppm1kQ8BXN7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppm1kQ8BXN7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppm1kQ8BXN7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppm1kQ8BXN7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppm1kQ8BXN7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppm1kQ8BXN7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppm1kQ8BXN7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppm1kQ8BXN7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppm1kQ8BXN7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppm1kQ8BXN7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppm1kQ8BXN7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppm1kQ8BXN7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppm1kQ8BXN7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms