Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trerf1Q8BXJ2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trerf1Q8BXJ2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trerf1Q8BXJ2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trerf1Q8BXJ2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trerf1Q8BXJ2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trerf1Q8BXJ2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trerf1Q8BXJ2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trerf1Q8BXJ2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trerf1Q8BXJ2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trerf1Q8BXJ2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trerf1Q8BXJ2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trerf1Q8BXJ2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trerf1Q8BXJ2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trerf1Q8BXJ2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trerf1Q8BXJ2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trerf1Q8BXJ2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trerf1Q8BXJ2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trerf1Q8BXJ2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trerf1Q8BXJ2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trerf1Q8BXJ2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trerf1Q8BXJ2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trerf1Q8BXJ2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trerf1Q8BXJ2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trerf1Q8BXJ2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trerf1Q8BXJ2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trerf1Q8BXJ2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trerf1Q8BXJ2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trerf1Q8BXJ2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trerf1Q8BXJ2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trerf1Q8BXJ2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trerf1Q8BXJ2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trerf1Q8BXJ2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trerf1Q8BXJ2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trerf1Q8BXJ2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trerf1Q8BXJ2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trerf1Q8BXJ2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trerf1Q8BXJ2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trerf1Q8BXJ2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trerf1Q8BXJ2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trerf1Q8BXJ2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trerf1Q8BXJ2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trerf1Q8BXJ2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trerf1Q8BXJ2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trerf1Q8BXJ2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trerf1Q8BXJ2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trerf1Q8BXJ2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trerf1Q8BXJ2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trerf1Q8BXJ2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trerf1Q8BXJ2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trerf1Q8BXJ2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trerf1Q8BXJ2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trerf1Q8BXJ2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trerf1Q8BXJ2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trerf1Q8BXJ2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trerf1Q8BXJ2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trerf1Q8BXJ2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trerf1Q8BXJ2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trerf1Q8BXJ2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trerf1Q8BXJ2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trerf1Q8BXJ2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trerf1Q8BXJ2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trerf1Q8BXJ2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trerf1Q8BXJ2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trerf1Q8BXJ2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trerf1Q8BXJ2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trerf1Q8BXJ2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trerf1Q8BXJ2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trerf1Q8BXJ2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trerf1Q8BXJ2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trerf1Q8BXJ2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trerf1Q8BXJ2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms