Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX35

Eda2r, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 27, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eda2rQ8BX35 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eda2rQ8BX35 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eda2rQ8BX35 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eda2rQ8BX35 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eda2rQ8BX35 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eda2rQ8BX35 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eda2rQ8BX35 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eda2rQ8BX35 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eda2rQ8BX35 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eda2rQ8BX35 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eda2rQ8BX35 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eda2rQ8BX35 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eda2rQ8BX35 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eda2rQ8BX35 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Eda2rQ8BX35 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eda2rQ8BX35 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eda2rQ8BX35 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eda2rQ8BX35 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eda2rQ8BX35 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms