Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVT6

Pp2d1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pp2d1Q8BVT6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pp2d1Q8BVT6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pp2d1Q8BVT6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pp2d1Q8BVT6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pp2d1Q8BVT6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pp2d1Q8BVT6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pp2d1Q8BVT6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pp2d1Q8BVT6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pp2d1Q8BVT6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pp2d1Q8BVT6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pp2d1Q8BVT6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pp2d1Q8BVT6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pp2d1Q8BVT6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pp2d1Q8BVT6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pp2d1Q8BVT6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pp2d1Q8BVT6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pp2d1Q8BVT6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pp2d1Q8BVT6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pp2d1Q8BVT6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pp2d1Q8BVT6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pp2d1Q8BVT6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pp2d1Q8BVT6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pp2d1Q8BVT6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pp2d1Q8BVT6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pp2d1Q8BVT6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pp2d1Q8BVT6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pp2d1Q8BVT6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pp2d1Q8BVT6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pp2d1Q8BVT6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pp2d1Q8BVT6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pp2d1Q8BVT6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pp2d1Q8BVT6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pp2d1Q8BVT6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pp2d1Q8BVT6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pp2d1Q8BVT6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pp2d1Q8BVT6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pp2d1Q8BVT6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pp2d1Q8BVT6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pp2d1Q8BVT6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pp2d1Q8BVT6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pp2d1Q8BVT6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pp2d1Q8BVT6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pp2d1Q8BVT6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pp2d1Q8BVT6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pp2d1Q8BVT6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pp2d1Q8BVT6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pp2d1Q8BVT6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pp2d1Q8BVT6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pp2d1Q8BVT6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pp2d1Q8BVT6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pp2d1Q8BVT6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pp2d1Q8BVT6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pp2d1Q8BVT6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pp2d1Q8BVT6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pp2d1Q8BVT6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pp2d1Q8BVT6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pp2d1Q8BVT6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pp2d1Q8BVT6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pp2d1Q8BVT6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pp2d1Q8BVT6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pp2d1Q8BVT6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pp2d1Q8BVT6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pp2d1Q8BVT6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pp2d1Q8BVT6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pp2d1Q8BVT6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pp2d1Q8BVT6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pp2d1Q8BVT6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pp2d1Q8BVT6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pp2d1Q8BVT6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pp2d1Q8BVT6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pp2d1Q8BVT6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pp2d1Q8BVT6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pp2d1Q8BVT6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pp2d1Q8BVT6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms