Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUD0

Gpr4, G-protein coupled receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr4Q8BUD0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpr4Q8BUD0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpr4Q8BUD0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpr4Q8BUD0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpr4Q8BUD0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpr4Q8BUD0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpr4Q8BUD0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpr4Q8BUD0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpr4Q8BUD0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpr4Q8BUD0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpr4Q8BUD0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpr4Q8BUD0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpr4Q8BUD0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpr4Q8BUD0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpr4Q8BUD0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpr4Q8BUD0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpr4Q8BUD0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpr4Q8BUD0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpr4Q8BUD0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpr4Q8BUD0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpr4Q8BUD0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpr4Q8BUD0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpr4Q8BUD0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpr4Q8BUD0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpr4Q8BUD0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpr4Q8BUD0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpr4Q8BUD0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpr4Q8BUD0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpr4Q8BUD0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpr4Q8BUD0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpr4Q8BUD0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpr4Q8BUD0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpr4Q8BUD0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpr4Q8BUD0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpr4Q8BUD0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpr4Q8BUD0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpr4Q8BUD0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpr4Q8BUD0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpr4Q8BUD0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpr4Q8BUD0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpr4Q8BUD0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpr4Q8BUD0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpr4Q8BUD0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpr4Q8BUD0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpr4Q8BUD0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpr4Q8BUD0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpr4Q8BUD0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpr4Q8BUD0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpr4Q8BUD0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpr4Q8BUD0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpr4Q8BUD0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpr4Q8BUD0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpr4Q8BUD0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpr4Q8BUD0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpr4Q8BUD0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpr4Q8BUD0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpr4Q8BUD0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpr4Q8BUD0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpr4Q8BUD0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpr4Q8BUD0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpr4Q8BUD0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpr4Q8BUD0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpr4Q8BUD0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpr4Q8BUD0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpr4Q8BUD0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpr4Q8BUD0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpr4Q8BUD0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpr4Q8BUD0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpr4Q8BUD0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpr4Q8BUD0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpr4Q8BUD0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpr4Q8BUD0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpr4Q8BUD0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms