Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PcgF3Q8BTQ0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PcgF3Q8BTQ0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PcgF3Q8BTQ0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PcgF3Q8BTQ0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PcgF3Q8BTQ0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PcgF3Q8BTQ0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PcgF3Q8BTQ0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PcgF3Q8BTQ0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PcgF3Q8BTQ0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PcgF3Q8BTQ0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PcgF3Q8BTQ0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PcgF3Q8BTQ0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PcgF3Q8BTQ0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PcgF3Q8BTQ0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PcgF3Q8BTQ0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PcgF3Q8BTQ0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PcgF3Q8BTQ0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PcgF3Q8BTQ0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PcgF3Q8BTQ0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PcgF3Q8BTQ0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PcgF3Q8BTQ0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PcgF3Q8BTQ0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PcgF3Q8BTQ0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PcgF3Q8BTQ0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PcgF3Q8BTQ0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PcgF3Q8BTQ0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PcgF3Q8BTQ0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PcgF3Q8BTQ0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PcgF3Q8BTQ0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PcgF3Q8BTQ0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PcgF3Q8BTQ0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PcgF3Q8BTQ0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PcgF3Q8BTQ0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PcgF3Q8BTQ0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PcgF3Q8BTQ0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PcgF3Q8BTQ0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PcgF3Q8BTQ0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PcgF3Q8BTQ0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PcgF3Q8BTQ0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PcgF3Q8BTQ0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PcgF3Q8BTQ0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PcgF3Q8BTQ0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PcgF3Q8BTQ0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PcgF3Q8BTQ0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PcgF3Q8BTQ0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PcgF3Q8BTQ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PcgF3Q8BTQ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PcgF3Q8BTQ0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PcgF3Q8BTQ0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PcgF3Q8BTQ0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PcgF3Q8BTQ0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PcgF3Q8BTQ0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PcgF3Q8BTQ0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PcgF3Q8BTQ0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PcgF3Q8BTQ0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PcgF3Q8BTQ0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PcgF3Q8BTQ0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PcgF3Q8BTQ0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PcgF3Q8BTQ0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PcgF3Q8BTQ0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PcgF3Q8BTQ0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PcgF3Q8BTQ0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PcgF3Q8BTQ0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PcgF3Q8BTQ0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PcgF3Q8BTQ0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PcgF3Q8BTQ0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PcgF3Q8BTQ0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PcgF3Q8BTQ0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PcgF3Q8BTQ0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PcgF3Q8BTQ0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PcgF3Q8BTQ0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PcgF3Q8BTQ0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PcgF3Q8BTQ0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PcgF3Q8BTQ0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PcgF3Q8BTQ0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PcgF3Q8BTQ0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PcgF3Q8BTQ0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PcgF3Q8BTQ0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms