Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rd3Q8BRE0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rd3Q8BRE0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rd3Q8BRE0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rd3Q8BRE0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rd3Q8BRE0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rd3Q8BRE0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Rd3Q8BRE0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rd3Q8BRE0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rd3Q8BRE0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rd3Q8BRE0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rd3Q8BRE0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rd3Q8BRE0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rd3Q8BRE0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rd3Q8BRE0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rd3Q8BRE0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rd3Q8BRE0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rd3Q8BRE0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rd3Q8BRE0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rd3Q8BRE0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rd3Q8BRE0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rd3Q8BRE0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rd3Q8BRE0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rd3Q8BRE0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rd3Q8BRE0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rd3Q8BRE0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rd3Q8BRE0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rd3Q8BRE0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rd3Q8BRE0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rd3Q8BRE0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rd3Q8BRE0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rd3Q8BRE0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rd3Q8BRE0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rd3Q8BRE0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rd3Q8BRE0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rd3Q8BRE0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rd3Q8BRE0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rd3Q8BRE0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rd3Q8BRE0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rd3Q8BRE0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rd3Q8BRE0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rd3Q8BRE0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rd3Q8BRE0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rd3Q8BRE0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rd3Q8BRE0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rd3Q8BRE0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rd3Q8BRE0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rd3Q8BRE0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rd3Q8BRE0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rd3Q8BRE0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rd3Q8BRE0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rd3Q8BRE0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rd3Q8BRE0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rd3Q8BRE0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rd3Q8BRE0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rd3Q8BRE0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rd3Q8BRE0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rd3Q8BRE0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rd3Q8BRE0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rd3Q8BRE0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rd3Q8BRE0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rd3Q8BRE0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rd3Q8BRE0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rd3Q8BRE0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rd3Q8BRE0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rd3Q8BRE0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rd3Q8BRE0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rd3Q8BRE0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rd3Q8BRE0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rd3Q8BRE0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rd3Q8BRE0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rd3Q8BRE0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms