Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHW4

4933430I17Rik, RIKEN cDNA 4933430I17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933430I17RikQ8BHW4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933430I17RikQ8BHW4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933430I17RikQ8BHW4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933430I17RikQ8BHW4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933430I17RikQ8BHW4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933430I17RikQ8BHW4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933430I17RikQ8BHW4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933430I17RikQ8BHW4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933430I17RikQ8BHW4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933430I17RikQ8BHW4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933430I17RikQ8BHW4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933430I17RikQ8BHW4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933430I17RikQ8BHW4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933430I17RikQ8BHW4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933430I17RikQ8BHW4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933430I17RikQ8BHW4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933430I17RikQ8BHW4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933430I17RikQ8BHW4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933430I17RikQ8BHW4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933430I17RikQ8BHW4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933430I17RikQ8BHW4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933430I17RikQ8BHW4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933430I17RikQ8BHW4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933430I17RikQ8BHW4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933430I17RikQ8BHW4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933430I17RikQ8BHW4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933430I17RikQ8BHW4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933430I17RikQ8BHW4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933430I17RikQ8BHW4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933430I17RikQ8BHW4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933430I17RikQ8BHW4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933430I17RikQ8BHW4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933430I17RikQ8BHW4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933430I17RikQ8BHW4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933430I17RikQ8BHW4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933430I17RikQ8BHW4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933430I17RikQ8BHW4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933430I17RikQ8BHW4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933430I17RikQ8BHW4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933430I17RikQ8BHW4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933430I17RikQ8BHW4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933430I17RikQ8BHW4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4933430I17RikQ8BHW4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4933430I17RikQ8BHW4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933430I17RikQ8BHW4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933430I17RikQ8BHW4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933430I17RikQ8BHW4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933430I17RikQ8BHW4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933430I17RikQ8BHW4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933430I17RikQ8BHW4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933430I17RikQ8BHW4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933430I17RikQ8BHW4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933430I17RikQ8BHW4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933430I17RikQ8BHW4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933430I17RikQ8BHW4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933430I17RikQ8BHW4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933430I17RikQ8BHW4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933430I17RikQ8BHW4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933430I17RikQ8BHW4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
4933430I17RikQ8BHW4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933430I17RikQ8BHW4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933430I17RikQ8BHW4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
4933430I17RikQ8BHW4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms