Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH55

Thnsl1, Threonine synthase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thnsl1Q8BH55 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Thnsl1Q8BH55 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Thnsl1Q8BH55 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Thnsl1Q8BH55 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Thnsl1Q8BH55 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Thnsl1Q8BH55 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Thnsl1Q8BH55 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Thnsl1Q8BH55 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Thnsl1Q8BH55 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Thnsl1Q8BH55 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Thnsl1Q8BH55 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Thnsl1Q8BH55 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Thnsl1Q8BH55 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Thnsl1Q8BH55 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Thnsl1Q8BH55 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Thnsl1Q8BH55 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Thnsl1Q8BH55 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Thnsl1Q8BH55 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Thnsl1Q8BH55 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Thnsl1Q8BH55 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Thnsl1Q8BH55 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Thnsl1Q8BH55 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Thnsl1Q8BH55 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Thnsl1Q8BH55 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Thnsl1Q8BH55 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Thnsl1Q8BH55 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Thnsl1Q8BH55 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Thnsl1Q8BH55 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Thnsl1Q8BH55 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Thnsl1Q8BH55 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Thnsl1Q8BH55 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Thnsl1Q8BH55 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Thnsl1Q8BH55 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Thnsl1Q8BH55 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Thnsl1Q8BH55 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Thnsl1Q8BH55 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Thnsl1Q8BH55 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Thnsl1Q8BH55 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Thnsl1Q8BH55 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Thnsl1Q8BH55 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Thnsl1Q8BH55 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Thnsl1Q8BH55 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Thnsl1Q8BH55 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Thnsl1Q8BH55 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Thnsl1Q8BH55 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Thnsl1Q8BH55 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Thnsl1Q8BH55 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Thnsl1Q8BH55 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Thnsl1Q8BH55 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Thnsl1Q8BH55 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thnsl1Q8BH55 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thnsl1Q8BH55 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thnsl1Q8BH55 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thnsl1Q8BH55 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Thnsl1Q8BH55 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Thnsl1Q8BH55 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Thnsl1Q8BH55 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Thnsl1Q8BH55 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thnsl1Q8BH55 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thnsl1Q8BH55 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thnsl1Q8BH55 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Thnsl1Q8BH55 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Thnsl1Q8BH55 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Thnsl1Q8BH55 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Thnsl1Q8BH55 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Thnsl1Q8BH55 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Thnsl1Q8BH55 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Thnsl1Q8BH55 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Thnsl1Q8BH55 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Thnsl1Q8BH55 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms