Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cyp4f39Q8BGU0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cyp4f39Q8BGU0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cyp4f39Q8BGU0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cyp4f39Q8BGU0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cyp4f39Q8BGU0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cyp4f39Q8BGU0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cyp4f39Q8BGU0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cyp4f39Q8BGU0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cyp4f39Q8BGU0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cyp4f39Q8BGU0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cyp4f39Q8BGU0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cyp4f39Q8BGU0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cyp4f39Q8BGU0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cyp4f39Q8BGU0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cyp4f39Q8BGU0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cyp4f39Q8BGU0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cyp4f39Q8BGU0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cyp4f39Q8BGU0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cyp4f39Q8BGU0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cyp4f39Q8BGU0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cyp4f39Q8BGU0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cyp4f39Q8BGU0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cyp4f39Q8BGU0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cyp4f39Q8BGU0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cyp4f39Q8BGU0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cyp4f39Q8BGU0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cyp4f39Q8BGU0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cyp4f39Q8BGU0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cyp4f39Q8BGU0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cyp4f39Q8BGU0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cyp4f39Q8BGU0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cyp4f39Q8BGU0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp4f39Q8BGU0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp4f39Q8BGU0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp4f39Q8BGU0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp4f39Q8BGU0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp4f39Q8BGU0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp4f39Q8BGU0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cyp4f39Q8BGU0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cyp4f39Q8BGU0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cyp4f39Q8BGU0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cyp4f39Q8BGU0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cyp4f39Q8BGU0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cyp4f39Q8BGU0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cyp4f39Q8BGU0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cyp4f39Q8BGU0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cyp4f39Q8BGU0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cyp4f39Q8BGU0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cyp4f39Q8BGU0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cyp4f39Q8BGU0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cyp4f39Q8BGU0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cyp4f39Q8BGU0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cyp4f39Q8BGU0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cyp4f39Q8BGU0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cyp4f39Q8BGU0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cyp4f39Q8BGU0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cyp4f39Q8BGU0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp4f39Q8BGU0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp4f39Q8BGU0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp4f39Q8BGU0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp4f39Q8BGU0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cyp4f39Q8BGU0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Cyp4f39Q8BGU0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cyp4f39Q8BGU0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cyp4f39Q8BGU0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cyp4f39Q8BGU0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cyp4f39Q8BGU0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cyp4f39Q8BGU0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cyp4f39Q8BGU0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cyp4f39Q8BGU0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cyp4f39Q8BGU0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cyp4f39Q8BGU0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cyp4f39Q8BGU0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cyp4f39Q8BGU0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cyp4f39Q8BGU0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Cyp4f39Q8BGU0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cyp4f39Q8BGU0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cyp4f39Q8BGU0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cyp4f39Q8BGU0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cyp4f39Q8BGU0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cyp4f39Q8BGU0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cyp4f39Q8BGU0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cyp4f39Q8BGU0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cyp4f39Q8BGU0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cyp4f39Q8BGU0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cyp4f39Q8BGU0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cyp4f39Q8BGU0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cyp4f39Q8BGU0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cyp4f39Q8BGU0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms