Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG51

Rhot1, Mitochondrial Rho GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhot1Q8BG51 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rhot1Q8BG51 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rhot1Q8BG51 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rhot1Q8BG51 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rhot1Q8BG51 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rhot1Q8BG51 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rhot1Q8BG51 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rhot1Q8BG51 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rhot1Q8BG51 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rhot1Q8BG51 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rhot1Q8BG51 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rhot1Q8BG51 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rhot1Q8BG51 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rhot1Q8BG51 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rhot1Q8BG51 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rhot1Q8BG51 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rhot1Q8BG51 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rhot1Q8BG51 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rhot1Q8BG51 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rhot1Q8BG51 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rhot1Q8BG51 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rhot1Q8BG51 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rhot1Q8BG51 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rhot1Q8BG51 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rhot1Q8BG51 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rhot1Q8BG51 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rhot1Q8BG51 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rhot1Q8BG51 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rhot1Q8BG51 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rhot1Q8BG51 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rhot1Q8BG51 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rhot1Q8BG51 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rhot1Q8BG51 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rhot1Q8BG51 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rhot1Q8BG51 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rhot1Q8BG51 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rhot1Q8BG51 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rhot1Q8BG51 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rhot1Q8BG51 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rhot1Q8BG51 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rhot1Q8BG51 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rhot1Q8BG51 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rhot1Q8BG51 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rhot1Q8BG51 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rhot1Q8BG51 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rhot1Q8BG51 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rhot1Q8BG51 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rhot1Q8BG51 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rhot1Q8BG51 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rhot1Q8BG51 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rhot1Q8BG51 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rhot1Q8BG51 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rhot1Q8BG51 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rhot1Q8BG51 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rhot1Q8BG51 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rhot1Q8BG51 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rhot1Q8BG51 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rhot1Q8BG51 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rhot1Q8BG51 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rhot1Q8BG51 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rhot1Q8BG51 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rhot1Q8BG51 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rhot1Q8BG51 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rhot1Q8BG51 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rhot1Q8BG51 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rhot1Q8BG51 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rhot1Q8BG51 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhot1Q8BG51 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhot1Q8BG51 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhot1Q8BG51 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhot1Q8BG51 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhot1Q8BG51 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhot1Q8BG51 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhot1Q8BG51 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms