Protein–RNA interactions for Protein: Q810P3

Cdkn3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn3Q810P3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdkn3Q810P3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdkn3Q810P3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdkn3Q810P3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdkn3Q810P3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkn3Q810P3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkn3Q810P3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkn3Q810P3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkn3Q810P3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkn3Q810P3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkn3Q810P3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdkn3Q810P3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdkn3Q810P3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdkn3Q810P3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdkn3Q810P3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdkn3Q810P3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdkn3Q810P3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdkn3Q810P3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdkn3Q810P3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdkn3Q810P3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdkn3Q810P3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdkn3Q810P3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdkn3Q810P3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdkn3Q810P3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdkn3Q810P3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdkn3Q810P3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdkn3Q810P3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdkn3Q810P3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdkn3Q810P3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdkn3Q810P3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdkn3Q810P3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdkn3Q810P3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdkn3Q810P3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdkn3Q810P3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdkn3Q810P3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdkn3Q810P3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdkn3Q810P3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdkn3Q810P3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdkn3Q810P3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkn3Q810P3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkn3Q810P3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkn3Q810P3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkn3Q810P3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkn3Q810P3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkn3Q810P3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkn3Q810P3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkn3Q810P3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkn3Q810P3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkn3Q810P3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkn3Q810P3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdkn3Q810P3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdkn3Q810P3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdkn3Q810P3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdkn3Q810P3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdkn3Q810P3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdkn3Q810P3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdkn3Q810P3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdkn3Q810P3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdkn3Q810P3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdkn3Q810P3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdkn3Q810P3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdkn3Q810P3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkn3Q810P3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkn3Q810P3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdkn3Q810P3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdkn3Q810P3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdkn3Q810P3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdkn3Q810P3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdkn3Q810P3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdkn3Q810P3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdkn3Q810P3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdkn3Q810P3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdkn3Q810P3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdkn3Q810P3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdkn3Q810P3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdkn3Q810P3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdkn3Q810P3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdkn3Q810P3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdkn3Q810P3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdkn3Q810P3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdkn3Q810P3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdkn3Q810P3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkn3Q810P3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkn3Q810P3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkn3Q810P3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdkn3Q810P3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdkn3Q810P3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdkn3Q810P3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkn3Q810P3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkn3Q810P3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkn3Q810P3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkn3Q810P3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkn3Q810P3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkn3Q810P3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkn3Q810P3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkn3Q810P3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdkn3Q810P3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdkn3Q810P3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdkn3Q810P3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdkn3Q810P3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms