Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim19Q80ZU4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim19Q80ZU4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim19Q80ZU4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim19Q80ZU4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim19Q80ZU4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim19Q80ZU4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim19Q80ZU4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim19Q80ZU4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim19Q80ZU4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim19Q80ZU4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim19Q80ZU4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim19Q80ZU4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim19Q80ZU4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim19Q80ZU4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim19Q80ZU4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim19Q80ZU4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim19Q80ZU4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim19Q80ZU4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim19Q80ZU4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim19Q80ZU4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim19Q80ZU4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim19Q80ZU4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim19Q80ZU4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim19Q80ZU4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim19Q80ZU4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim19Q80ZU4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim19Q80ZU4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim19Q80ZU4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim19Q80ZU4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim19Q80ZU4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim19Q80ZU4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim19Q80ZU4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim19Q80ZU4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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