Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn34b3Q80ZS5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn34b3Q80ZS5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn34b3Q80ZS5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn34b3Q80ZS5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn34b3Q80ZS5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn34b3Q80ZS5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn34b3Q80ZS5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn34b3Q80ZS5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn34b3Q80ZS5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn34b3Q80ZS5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn34b3Q80ZS5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn34b3Q80ZS5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn34b3Q80ZS5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn34b3Q80ZS5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn34b3Q80ZS5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34b3Q80ZS5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34b3Q80ZS5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34b3Q80ZS5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn34b3Q80ZS5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn34b3Q80ZS5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn34b3Q80ZS5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34b3Q80ZS5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34b3Q80ZS5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn34b3Q80ZS5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b3Q80ZS5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b3Q80ZS5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b3Q80ZS5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b3Q80ZS5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b3Q80ZS5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b3Q80ZS5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn34b3Q80ZS5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn34b3Q80ZS5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn34b3Q80ZS5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn34b3Q80ZS5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn34b3Q80ZS5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn34b3Q80ZS5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn34b3Q80ZS5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn34b3Q80ZS5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn34b3Q80ZS5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn34b3Q80ZS5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn34b3Q80ZS5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn34b3Q80ZS5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn34b3Q80ZS5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn34b3Q80ZS5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn34b3Q80ZS5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn34b3Q80ZS5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn34b3Q80ZS5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn34b3Q80ZS5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn34b3Q80ZS5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn34b3Q80ZS5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn34b3Q80ZS5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn34b3Q80ZS5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn34b3Q80ZS5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn34b3Q80ZS5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn34b3Q80ZS5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cldn34b3Q80ZS5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34b3Q80ZS5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34b3Q80ZS5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34b3Q80ZS5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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