Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ6

Zer1, Protein zer-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zer1Q80ZJ6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zer1Q80ZJ6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zer1Q80ZJ6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zer1Q80ZJ6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zer1Q80ZJ6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zer1Q80ZJ6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zer1Q80ZJ6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zer1Q80ZJ6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zer1Q80ZJ6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zer1Q80ZJ6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zer1Q80ZJ6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zer1Q80ZJ6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zer1Q80ZJ6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zer1Q80ZJ6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zer1Q80ZJ6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zer1Q80ZJ6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zer1Q80ZJ6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zer1Q80ZJ6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zer1Q80ZJ6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zer1Q80ZJ6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zer1Q80ZJ6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zer1Q80ZJ6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zer1Q80ZJ6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zer1Q80ZJ6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Zer1Q80ZJ6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zer1Q80ZJ6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zer1Q80ZJ6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zer1Q80ZJ6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zer1Q80ZJ6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zer1Q80ZJ6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zer1Q80ZJ6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zer1Q80ZJ6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zer1Q80ZJ6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Zer1Q80ZJ6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zer1Q80ZJ6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Zer1Q80ZJ6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Zer1Q80ZJ6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zer1Q80ZJ6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zer1Q80ZJ6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zer1Q80ZJ6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zer1Q80ZJ6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zer1Q80ZJ6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Zer1Q80ZJ6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Zer1Q80ZJ6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.4 ms