Protein–RNA interactions for Protein: Q80XS6

Samd4b, Protein Smaug homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4bQ80XS6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samd4bQ80XS6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samd4bQ80XS6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samd4bQ80XS6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samd4bQ80XS6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samd4bQ80XS6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samd4bQ80XS6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samd4bQ80XS6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Samd4bQ80XS6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Samd4bQ80XS6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd4bQ80XS6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Samd4bQ80XS6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Samd4bQ80XS6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd4bQ80XS6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd4bQ80XS6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd4bQ80XS6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd4bQ80XS6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd4bQ80XS6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd4bQ80XS6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd4bQ80XS6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd4bQ80XS6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd4bQ80XS6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd4bQ80XS6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd4bQ80XS6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd4bQ80XS6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samd4bQ80XS6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samd4bQ80XS6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samd4bQ80XS6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd4bQ80XS6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd4bQ80XS6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd4bQ80XS6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd4bQ80XS6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd4bQ80XS6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd4bQ80XS6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd4bQ80XS6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd4bQ80XS6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd4bQ80XS6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd4bQ80XS6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd4bQ80XS6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms