Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnupnQ80W37 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnupnQ80W37 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnupnQ80W37 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SnupnQ80W37 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnupnQ80W37 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnupnQ80W37 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnupnQ80W37 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnupnQ80W37 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnupnQ80W37 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnupnQ80W37 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnupnQ80W37 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnupnQ80W37 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SnupnQ80W37 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnupnQ80W37 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnupnQ80W37 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnupnQ80W37 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnupnQ80W37 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms