Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf516Q7TSH3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf516Q7TSH3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf516Q7TSH3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf516Q7TSH3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf516Q7TSH3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf516Q7TSH3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf516Q7TSH3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf516Q7TSH3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf516Q7TSH3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf516Q7TSH3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf516Q7TSH3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf516Q7TSH3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf516Q7TSH3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf516Q7TSH3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf516Q7TSH3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf516Q7TSH3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf516Q7TSH3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf516Q7TSH3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf516Q7TSH3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf516Q7TSH3 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf516Q7TSH3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf516Q7TSH3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf516Q7TSH3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf516Q7TSH3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf516Q7TSH3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Znf516Q7TSH3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf516Q7TSH3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf516Q7TSH3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf516Q7TSH3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf516Q7TSH3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf516Q7TSH3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf516Q7TSH3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf516Q7TSH3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf516Q7TSH3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf516Q7TSH3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf516Q7TSH3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf516Q7TSH3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf516Q7TSH3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf516Q7TSH3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms