Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg1cQ7TSF0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg1cQ7TSF0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg1cQ7TSF0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg1cQ7TSF0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg1cQ7TSF0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg1cQ7TSF0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg1cQ7TSF0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg1cQ7TSF0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg1cQ7TSF0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dsg1cQ7TSF0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dsg1cQ7TSF0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg1cQ7TSF0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg1cQ7TSF0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg1cQ7TSF0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg1cQ7TSF0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg1cQ7TSF0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dsg1cQ7TSF0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dsg1cQ7TSF0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dsg1cQ7TSF0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dsg1cQ7TSF0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg1cQ7TSF0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg1cQ7TSF0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dsg1cQ7TSF0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dsg1cQ7TSF0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dsg1cQ7TSF0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dsg1cQ7TSF0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Dsg1cQ7TSF0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dsg1cQ7TSF0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dsg1cQ7TSF0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dsg1cQ7TSF0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dsg1cQ7TSF0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dsg1cQ7TSF0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dsg1cQ7TSF0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg1cQ7TSF0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg1cQ7TSF0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1cQ7TSF0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1cQ7TSF0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1cQ7TSF0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1cQ7TSF0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1cQ7TSF0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Dsg1cQ7TSF0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dsg1cQ7TSF0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Dsg1cQ7TSF0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dsg1cQ7TSF0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dsg1cQ7TSF0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dsg1cQ7TSF0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dsg1cQ7TSF0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dsg1cQ7TSF0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dsg1cQ7TSF0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dsg1cQ7TSF0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dsg1cQ7TSF0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dsg1cQ7TSF0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dsg1cQ7TSF0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dsg1cQ7TSF0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dsg1cQ7TSF0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dsg1cQ7TSF0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dsg1cQ7TSF0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dsg1cQ7TSF0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Dsg1cQ7TSF0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dsg1cQ7TSF0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dsg1cQ7TSF0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dsg1cQ7TSF0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dsg1cQ7TSF0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dsg1cQ7TSF0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dsg1cQ7TSF0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dsg1cQ7TSF0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms