Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPY9

Ldoc1, Protein LDOC1, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldoc1Q7TPY9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ldoc1Q7TPY9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ldoc1Q7TPY9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ldoc1Q7TPY9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ldoc1Q7TPY9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ldoc1Q7TPY9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ldoc1Q7TPY9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ldoc1Q7TPY9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ldoc1Q7TPY9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ldoc1Q7TPY9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ldoc1Q7TPY9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ldoc1Q7TPY9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ldoc1Q7TPY9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ldoc1Q7TPY9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ldoc1Q7TPY9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ldoc1Q7TPY9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ldoc1Q7TPY9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ldoc1Q7TPY9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ldoc1Q7TPY9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ldoc1Q7TPY9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ldoc1Q7TPY9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ldoc1Q7TPY9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ldoc1Q7TPY9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ldoc1Q7TPY9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ldoc1Q7TPY9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ldoc1Q7TPY9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ldoc1Q7TPY9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ldoc1Q7TPY9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ldoc1Q7TPY9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ldoc1Q7TPY9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ldoc1Q7TPY9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ldoc1Q7TPY9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ldoc1Q7TPY9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ldoc1Q7TPY9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ldoc1Q7TPY9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ldoc1Q7TPY9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ldoc1Q7TPY9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ldoc1Q7TPY9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ldoc1Q7TPY9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ldoc1Q7TPY9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ldoc1Q7TPY9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ldoc1Q7TPY9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ldoc1Q7TPY9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ldoc1Q7TPY9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ldoc1Q7TPY9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ldoc1Q7TPY9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ldoc1Q7TPY9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms