Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ShprhQ7TPQ3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
ShprhQ7TPQ3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ShprhQ7TPQ3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ShprhQ7TPQ3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ShprhQ7TPQ3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ShprhQ7TPQ3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ShprhQ7TPQ3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
ShprhQ7TPQ3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ShprhQ7TPQ3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ShprhQ7TPQ3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ShprhQ7TPQ3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
ShprhQ7TPQ3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ShprhQ7TPQ3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ShprhQ7TPQ3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ShprhQ7TPQ3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ShprhQ7TPQ3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ShprhQ7TPQ3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ShprhQ7TPQ3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ShprhQ7TPQ3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ShprhQ7TPQ3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ShprhQ7TPQ3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ShprhQ7TPQ3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
ShprhQ7TPQ3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ShprhQ7TPQ3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ShprhQ7TPQ3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ShprhQ7TPQ3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ShprhQ7TPQ3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
ShprhQ7TPQ3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ShprhQ7TPQ3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ShprhQ7TPQ3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ShprhQ7TPQ3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ShprhQ7TPQ3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ShprhQ7TPQ3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ShprhQ7TPQ3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
ShprhQ7TPQ3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ShprhQ7TPQ3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ShprhQ7TPQ3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
ShprhQ7TPQ3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ShprhQ7TPQ3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ShprhQ7TPQ3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ShprhQ7TPQ3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ShprhQ7TPQ3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ShprhQ7TPQ3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ShprhQ7TPQ3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ShprhQ7TPQ3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ShprhQ7TPQ3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ShprhQ7TPQ3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ShprhQ7TPQ3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ShprhQ7TPQ3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ShprhQ7TPQ3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
ShprhQ7TPQ3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ShprhQ7TPQ3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ShprhQ7TPQ3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ShprhQ7TPQ3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ShprhQ7TPQ3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ShprhQ7TPQ3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
ShprhQ7TPQ3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ShprhQ7TPQ3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ShprhQ7TPQ3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ShprhQ7TPQ3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
ShprhQ7TPQ3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ShprhQ7TPQ3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ShprhQ7TPQ3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ShprhQ7TPQ3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ShprhQ7TPQ3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ShprhQ7TPQ3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ShprhQ7TPQ3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ShprhQ7TPQ3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ShprhQ7TPQ3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ShprhQ7TPQ3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ShprhQ7TPQ3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ShprhQ7TPQ3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ShprhQ7TPQ3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ShprhQ7TPQ3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ShprhQ7TPQ3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ShprhQ7TPQ3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ShprhQ7TPQ3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ShprhQ7TPQ3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ShprhQ7TPQ3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ShprhQ7TPQ3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ShprhQ7TPQ3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ShprhQ7TPQ3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ShprhQ7TPQ3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ShprhQ7TPQ3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ShprhQ7TPQ3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ShprhQ7TPQ3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ShprhQ7TPQ3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ShprhQ7TPQ3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ShprhQ7TPQ3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ShprhQ7TPQ3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ShprhQ7TPQ3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ShprhQ7TPQ3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ShprhQ7TPQ3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ShprhQ7TPQ3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ShprhQ7TPQ3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ShprhQ7TPQ3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ShprhQ7TPQ3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ShprhQ7TPQ3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ShprhQ7TPQ3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms