Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim17Q7TPM3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim17Q7TPM3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim17Q7TPM3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim17Q7TPM3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim17Q7TPM3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim17Q7TPM3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim17Q7TPM3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim17Q7TPM3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim17Q7TPM3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim17Q7TPM3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim17Q7TPM3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim17Q7TPM3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim17Q7TPM3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim17Q7TPM3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim17Q7TPM3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim17Q7TPM3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim17Q7TPM3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim17Q7TPM3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim17Q7TPM3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim17Q7TPM3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim17Q7TPM3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim17Q7TPM3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim17Q7TPM3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trim17Q7TPM3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trim17Q7TPM3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trim17Q7TPM3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim17Q7TPM3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim17Q7TPM3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim17Q7TPM3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim17Q7TPM3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim17Q7TPM3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim17Q7TPM3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim17Q7TPM3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim17Q7TPM3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim17Q7TPM3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim17Q7TPM3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim17Q7TPM3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim17Q7TPM3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim17Q7TPM3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim17Q7TPM3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim17Q7TPM3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim17Q7TPM3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim17Q7TPM3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim17Q7TPM3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim17Q7TPM3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim17Q7TPM3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim17Q7TPM3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim17Q7TPM3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim17Q7TPM3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim17Q7TPM3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim17Q7TPM3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim17Q7TPM3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim17Q7TPM3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim17Q7TPM3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim17Q7TPM3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim17Q7TPM3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim17Q7TPM3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim17Q7TPM3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim17Q7TPM3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim17Q7TPM3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim17Q7TPM3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim17Q7TPM3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim17Q7TPM3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim17Q7TPM3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim17Q7TPM3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim17Q7TPM3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim17Q7TPM3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim17Q7TPM3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim17Q7TPM3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim17Q7TPM3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim17Q7TPM3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim17Q7TPM3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim17Q7TPM3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim17Q7TPM3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim17Q7TPM3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim17Q7TPM3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim17Q7TPM3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim17Q7TPM3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim17Q7TPM3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim17Q7TPM3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim17Q7TPM3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim17Q7TPM3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms