Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sbno2Q7TNB8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sbno2Q7TNB8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sbno2Q7TNB8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sbno2Q7TNB8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sbno2Q7TNB8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sbno2Q7TNB8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sbno2Q7TNB8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sbno2Q7TNB8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sbno2Q7TNB8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sbno2Q7TNB8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sbno2Q7TNB8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sbno2Q7TNB8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sbno2Q7TNB8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sbno2Q7TNB8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sbno2Q7TNB8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sbno2Q7TNB8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Sbno2Q7TNB8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sbno2Q7TNB8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.8
Sbno2Q7TNB8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sbno2Q7TNB8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sbno2Q7TNB8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sbno2Q7TNB8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sbno2Q7TNB8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sbno2Q7TNB8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sbno2Q7TNB8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sbno2Q7TNB8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sbno2Q7TNB8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sbno2Q7TNB8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sbno2Q7TNB8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sbno2Q7TNB8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Sbno2Q7TNB8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sbno2Q7TNB8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Sbno2Q7TNB8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sbno2Q7TNB8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sbno2Q7TNB8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sbno2Q7TNB8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sbno2Q7TNB8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sbno2Q7TNB8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sbno2Q7TNB8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sbno2Q7TNB8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Sbno2Q7TNB8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sbno2Q7TNB8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Sbno2Q7TNB8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Sbno2Q7TNB8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sbno2Q7TNB8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sbno2Q7TNB8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sbno2Q7TNB8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sbno2Q7TNB8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sbno2Q7TNB8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Sbno2Q7TNB8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sbno2Q7TNB8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Sbno2Q7TNB8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sbno2Q7TNB8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sbno2Q7TNB8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sbno2Q7TNB8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Sbno2Q7TNB8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Sbno2Q7TNB8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Sbno2Q7TNB8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Sbno2Q7TNB8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sbno2Q7TNB8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sbno2Q7TNB8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Sbno2Q7TNB8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Sbno2Q7TNB8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sbno2Q7TNB8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sbno2Q7TNB8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sbno2Q7TNB8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sbno2Q7TNB8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sbno2Q7TNB8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sbno2Q7TNB8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sbno2Q7TNB8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sbno2Q7TNB8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Sbno2Q7TNB8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sbno2Q7TNB8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sbno2Q7TNB8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Sbno2Q7TNB8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Sbno2Q7TNB8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Sbno2Q7TNB8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sbno2Q7TNB8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sbno2Q7TNB8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Sbno2Q7TNB8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sbno2Q7TNB8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sbno2Q7TNB8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sbno2Q7TNB8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sbno2Q7TNB8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sbno2Q7TNB8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Sbno2Q7TNB8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sbno2Q7TNB8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sbno2Q7TNB8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sbno2Q7TNB8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sbno2Q7TNB8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sbno2Q7TNB8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sbno2Q7TNB8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sbno2Q7TNB8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sbno2Q7TNB8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sbno2Q7TNB8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sbno2Q7TNB8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sbno2Q7TNB8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sbno2Q7TNB8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sbno2Q7TNB8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms