Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RfflQ6ZQM0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RfflQ6ZQM0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RfflQ6ZQM0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RfflQ6ZQM0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RfflQ6ZQM0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RfflQ6ZQM0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RfflQ6ZQM0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RfflQ6ZQM0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RfflQ6ZQM0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RfflQ6ZQM0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RfflQ6ZQM0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RfflQ6ZQM0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RfflQ6ZQM0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RfflQ6ZQM0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RfflQ6ZQM0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RfflQ6ZQM0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RfflQ6ZQM0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RfflQ6ZQM0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RfflQ6ZQM0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RfflQ6ZQM0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RfflQ6ZQM0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RfflQ6ZQM0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RfflQ6ZQM0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RfflQ6ZQM0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RfflQ6ZQM0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RfflQ6ZQM0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RfflQ6ZQM0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RfflQ6ZQM0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RfflQ6ZQM0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RfflQ6ZQM0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RfflQ6ZQM0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RfflQ6ZQM0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RfflQ6ZQM0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RfflQ6ZQM0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RfflQ6ZQM0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RfflQ6ZQM0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RfflQ6ZQM0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RfflQ6ZQM0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RfflQ6ZQM0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RfflQ6ZQM0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RfflQ6ZQM0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RfflQ6ZQM0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RfflQ6ZQM0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RfflQ6ZQM0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RfflQ6ZQM0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RfflQ6ZQM0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RfflQ6ZQM0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RfflQ6ZQM0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RfflQ6ZQM0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RfflQ6ZQM0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RfflQ6ZQM0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RfflQ6ZQM0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RfflQ6ZQM0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RfflQ6ZQM0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RfflQ6ZQM0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RfflQ6ZQM0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RfflQ6ZQM0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RfflQ6ZQM0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RfflQ6ZQM0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RfflQ6ZQM0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RfflQ6ZQM0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RfflQ6ZQM0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RfflQ6ZQM0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RfflQ6ZQM0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RfflQ6ZQM0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RfflQ6ZQM0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RfflQ6ZQM0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RfflQ6ZQM0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RfflQ6ZQM0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RfflQ6ZQM0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RfflQ6ZQM0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RfflQ6ZQM0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RfflQ6ZQM0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms