Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ncapd3Q6ZQK0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ncapd3Q6ZQK0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ncapd3Q6ZQK0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ncapd3Q6ZQK0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ncapd3Q6ZQK0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Ncapd3Q6ZQK0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ncapd3Q6ZQK0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ncapd3Q6ZQK0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ncapd3Q6ZQK0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ncapd3Q6ZQK0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ncapd3Q6ZQK0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ncapd3Q6ZQK0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ncapd3Q6ZQK0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ncapd3Q6ZQK0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ncapd3Q6ZQK0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Ncapd3Q6ZQK0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Ncapd3Q6ZQK0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
Ncapd3Q6ZQK0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Ncapd3Q6ZQK0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ncapd3Q6ZQK0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ncapd3Q6ZQK0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ncapd3Q6ZQK0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ncapd3Q6ZQK0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ncapd3Q6ZQK0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ncapd3Q6ZQK0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Ncapd3Q6ZQK0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Ncapd3Q6ZQK0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ncapd3Q6ZQK0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Ncapd3Q6ZQK0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ncapd3Q6ZQK0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ncapd3Q6ZQK0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Ncapd3Q6ZQK0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Ncapd3Q6ZQK0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ncapd3Q6ZQK0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ncapd3Q6ZQK0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Ncapd3Q6ZQK0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ncapd3Q6ZQK0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ncapd3Q6ZQK0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ncapd3Q6ZQK0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ncapd3Q6ZQK0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ncapd3Q6ZQK0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ncapd3Q6ZQK0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ncapd3Q6ZQK0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ncapd3Q6ZQK0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Ncapd3Q6ZQK0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ncapd3Q6ZQK0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ncapd3Q6ZQK0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ncapd3Q6ZQK0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ncapd3Q6ZQK0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ncapd3Q6ZQK0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Ncapd3Q6ZQK0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Ncapd3Q6ZQK0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ncapd3Q6ZQK0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ncapd3Q6ZQK0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ncapd3Q6ZQK0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ncapd3Q6ZQK0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ncapd3Q6ZQK0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ncapd3Q6ZQK0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ncapd3Q6ZQK0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Ncapd3Q6ZQK0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Ncapd3Q6ZQK0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ncapd3Q6ZQK0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ncapd3Q6ZQK0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ncapd3Q6ZQK0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ncapd3Q6ZQK0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ncapd3Q6ZQK0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Ncapd3Q6ZQK0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ncapd3Q6ZQK0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ncapd3Q6ZQK0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ncapd3Q6ZQK0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ncapd3Q6ZQK0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ncapd3Q6ZQK0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ncapd3Q6ZQK0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ncapd3Q6ZQK0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms