Protein–RNA interactions for Protein: Q6X1Y6

Asic3, Acid-sensing ion channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic3Q6X1Y6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Asic3Q6X1Y6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Asic3Q6X1Y6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Asic3Q6X1Y6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Asic3Q6X1Y6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Asic3Q6X1Y6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Asic3Q6X1Y6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Asic3Q6X1Y6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Asic3Q6X1Y6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Asic3Q6X1Y6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Asic3Q6X1Y6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Asic3Q6X1Y6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Asic3Q6X1Y6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Asic3Q6X1Y6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Asic3Q6X1Y6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Asic3Q6X1Y6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Asic3Q6X1Y6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Asic3Q6X1Y6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Asic3Q6X1Y6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Asic3Q6X1Y6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Asic3Q6X1Y6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Asic3Q6X1Y6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Asic3Q6X1Y6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Asic3Q6X1Y6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Asic3Q6X1Y6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Asic3Q6X1Y6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Asic3Q6X1Y6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Asic3Q6X1Y6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Asic3Q6X1Y6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Asic3Q6X1Y6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Asic3Q6X1Y6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Asic3Q6X1Y6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Asic3Q6X1Y6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Asic3Q6X1Y6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Asic3Q6X1Y6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Asic3Q6X1Y6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Asic3Q6X1Y6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Asic3Q6X1Y6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Asic3Q6X1Y6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Asic3Q6X1Y6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Asic3Q6X1Y6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Asic3Q6X1Y6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Asic3Q6X1Y6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Asic3Q6X1Y6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Asic3Q6X1Y6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Asic3Q6X1Y6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Asic3Q6X1Y6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Asic3Q6X1Y6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Asic3Q6X1Y6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Asic3Q6X1Y6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Asic3Q6X1Y6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Asic3Q6X1Y6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Asic3Q6X1Y6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Asic3Q6X1Y6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Asic3Q6X1Y6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Asic3Q6X1Y6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Asic3Q6X1Y6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Asic3Q6X1Y6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Asic3Q6X1Y6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Asic3Q6X1Y6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Asic3Q6X1Y6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Asic3Q6X1Y6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Asic3Q6X1Y6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Asic3Q6X1Y6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Asic3Q6X1Y6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Asic3Q6X1Y6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Asic3Q6X1Y6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Asic3Q6X1Y6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Asic3Q6X1Y6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Asic3Q6X1Y6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Asic3Q6X1Y6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Asic3Q6X1Y6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Asic3Q6X1Y6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Asic3Q6X1Y6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Asic3Q6X1Y6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Asic3Q6X1Y6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Asic3Q6X1Y6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Asic3Q6X1Y6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Asic3Q6X1Y6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Asic3Q6X1Y6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Asic3Q6X1Y6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Asic3Q6X1Y6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Asic3Q6X1Y6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Asic3Q6X1Y6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Asic3Q6X1Y6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Asic3Q6X1Y6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Asic3Q6X1Y6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Asic3Q6X1Y6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Asic3Q6X1Y6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Asic3Q6X1Y6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Asic3Q6X1Y6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Asic3Q6X1Y6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Asic3Q6X1Y6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Asic3Q6X1Y6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Asic3Q6X1Y6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms