Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE54

Dhx40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx40Q6PE54 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dhx40Q6PE54 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Dhx40Q6PE54 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dhx40Q6PE54 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dhx40Q6PE54 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dhx40Q6PE54 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dhx40Q6PE54 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dhx40Q6PE54 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dhx40Q6PE54 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dhx40Q6PE54 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dhx40Q6PE54 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Dhx40Q6PE54 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dhx40Q6PE54 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dhx40Q6PE54 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Dhx40Q6PE54 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dhx40Q6PE54 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dhx40Q6PE54 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dhx40Q6PE54 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dhx40Q6PE54 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dhx40Q6PE54 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dhx40Q6PE54 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dhx40Q6PE54 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dhx40Q6PE54 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dhx40Q6PE54 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Dhx40Q6PE54 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dhx40Q6PE54 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Dhx40Q6PE54 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dhx40Q6PE54 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dhx40Q6PE54 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dhx40Q6PE54 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dhx40Q6PE54 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dhx40Q6PE54 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dhx40Q6PE54 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dhx40Q6PE54 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Dhx40Q6PE54 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dhx40Q6PE54 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dhx40Q6PE54 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dhx40Q6PE54 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dhx40Q6PE54 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dhx40Q6PE54 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dhx40Q6PE54 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dhx40Q6PE54 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dhx40Q6PE54 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dhx40Q6PE54 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dhx40Q6PE54 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dhx40Q6PE54 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dhx40Q6PE54 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dhx40Q6PE54 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dhx40Q6PE54 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dhx40Q6PE54 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dhx40Q6PE54 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dhx40Q6PE54 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dhx40Q6PE54 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dhx40Q6PE54 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dhx40Q6PE54 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dhx40Q6PE54 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dhx40Q6PE54 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dhx40Q6PE54 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dhx40Q6PE54 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dhx40Q6PE54 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Dhx40Q6PE54 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dhx40Q6PE54 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dhx40Q6PE54 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dhx40Q6PE54 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dhx40Q6PE54 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dhx40Q6PE54 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dhx40Q6PE54 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dhx40Q6PE54 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dhx40Q6PE54 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dhx40Q6PE54 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Dhx40Q6PE54 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dhx40Q6PE54 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dhx40Q6PE54 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dhx40Q6PE54 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Dhx40Q6PE54 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dhx40Q6PE54 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dhx40Q6PE54 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dhx40Q6PE54 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dhx40Q6PE54 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dhx40Q6PE54 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dhx40Q6PE54 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dhx40Q6PE54 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dhx40Q6PE54 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Dhx40Q6PE54 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Dhx40Q6PE54 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dhx40Q6PE54 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dhx40Q6PE54 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Dhx40Q6PE54 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dhx40Q6PE54 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dhx40Q6PE54 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dhx40Q6PE54 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dhx40Q6PE54 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dhx40Q6PE54 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dhx40Q6PE54 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dhx40Q6PE54 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dhx40Q6PE54 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dhx40Q6PE54 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dhx40Q6PE54 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dhx40Q6PE54 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dhx40Q6PE54 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms