Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf1cQ6PDZ2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf1cQ6PDZ2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf1cQ6PDZ2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf1cQ6PDZ2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf1cQ6PDZ2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf1cQ6PDZ2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf1cQ6PDZ2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf1cQ6PDZ2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf1cQ6PDZ2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf1cQ6PDZ2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf1cQ6PDZ2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Taf1cQ6PDZ2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf1cQ6PDZ2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf1cQ6PDZ2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf1cQ6PDZ2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf1cQ6PDZ2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf1cQ6PDZ2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf1cQ6PDZ2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf1cQ6PDZ2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf1cQ6PDZ2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf1cQ6PDZ2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf1cQ6PDZ2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf1cQ6PDZ2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Taf1cQ6PDZ2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Taf1cQ6PDZ2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Taf1cQ6PDZ2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Taf1cQ6PDZ2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Taf1cQ6PDZ2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf1cQ6PDZ2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf1cQ6PDZ2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf1cQ6PDZ2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf1cQ6PDZ2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Taf1cQ6PDZ2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Taf1cQ6PDZ2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Taf1cQ6PDZ2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Taf1cQ6PDZ2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf1cQ6PDZ2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf1cQ6PDZ2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf1cQ6PDZ2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf1cQ6PDZ2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf1cQ6PDZ2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Taf1cQ6PDZ2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Taf1cQ6PDZ2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Taf1cQ6PDZ2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Taf1cQ6PDZ2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Taf1cQ6PDZ2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf1cQ6PDZ2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf1cQ6PDZ2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf1cQ6PDZ2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf1cQ6PDZ2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf1cQ6PDZ2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf1cQ6PDZ2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf1cQ6PDZ2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf1cQ6PDZ2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf1cQ6PDZ2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf1cQ6PDZ2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf1cQ6PDZ2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Taf1cQ6PDZ2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf1cQ6PDZ2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf1cQ6PDZ2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf1cQ6PDZ2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf1cQ6PDZ2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf1cQ6PDZ2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf1cQ6PDZ2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf1cQ6PDZ2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf1cQ6PDZ2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf1cQ6PDZ2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf1cQ6PDZ2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf1cQ6PDZ2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf1cQ6PDZ2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf1cQ6PDZ2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1cQ6PDZ2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1cQ6PDZ2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1cQ6PDZ2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1cQ6PDZ2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1cQ6PDZ2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1cQ6PDZ2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1cQ6PDZ2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1cQ6PDZ2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1cQ6PDZ2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1cQ6PDZ2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1cQ6PDZ2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1cQ6PDZ2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1cQ6PDZ2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1cQ6PDZ2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1cQ6PDZ2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1cQ6PDZ2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf1cQ6PDZ2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf1cQ6PDZ2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf1cQ6PDZ2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf1cQ6PDZ2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf1cQ6PDZ2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf1cQ6PDZ2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf1cQ6PDZ2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf1cQ6PDZ2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf1cQ6PDZ2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf1cQ6PDZ2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf1cQ6PDZ2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf1cQ6PDZ2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms