Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ecm29Q6PDI5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ecm29Q6PDI5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ecm29Q6PDI5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ecm29Q6PDI5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ecm29Q6PDI5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ecm29Q6PDI5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ecm29Q6PDI5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ecm29Q6PDI5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ecm29Q6PDI5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ecm29Q6PDI5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ecm29Q6PDI5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ecm29Q6PDI5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ecm29Q6PDI5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ecm29Q6PDI5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ecm29Q6PDI5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ecm29Q6PDI5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ecm29Q6PDI5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ecm29Q6PDI5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ecm29Q6PDI5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ecm29Q6PDI5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ecm29Q6PDI5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ecm29Q6PDI5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ecm29Q6PDI5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ecm29Q6PDI5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ecm29Q6PDI5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ecm29Q6PDI5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ecm29Q6PDI5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ecm29Q6PDI5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ecm29Q6PDI5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ecm29Q6PDI5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ecm29Q6PDI5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ecm29Q6PDI5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ecm29Q6PDI5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ecm29Q6PDI5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ecm29Q6PDI5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ecm29Q6PDI5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ecm29Q6PDI5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ecm29Q6PDI5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ecm29Q6PDI5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ecm29Q6PDI5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ecm29Q6PDI5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ecm29Q6PDI5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ecm29Q6PDI5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ecm29Q6PDI5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ecm29Q6PDI5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ecm29Q6PDI5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ecm29Q6PDI5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ecm29Q6PDI5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ecm29Q6PDI5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ecm29Q6PDI5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ecm29Q6PDI5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ecm29Q6PDI5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ecm29Q6PDI5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ecm29Q6PDI5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ecm29Q6PDI5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ecm29Q6PDI5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ecm29Q6PDI5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ecm29Q6PDI5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ecm29Q6PDI5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ecm29Q6PDI5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ecm29Q6PDI5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ecm29Q6PDI5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ecm29Q6PDI5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ecm29Q6PDI5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ecm29Q6PDI5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ecm29Q6PDI5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ecm29Q6PDI5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ecm29Q6PDI5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ecm29Q6PDI5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ecm29Q6PDI5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ecm29Q6PDI5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ecm29Q6PDI5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ecm29Q6PDI5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ecm29Q6PDI5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ecm29Q6PDI5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ecm29Q6PDI5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ecm29Q6PDI5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ecm29Q6PDI5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ecm29Q6PDI5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ecm29Q6PDI5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ecm29Q6PDI5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ecm29Q6PDI5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ecm29Q6PDI5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ecm29Q6PDI5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ecm29Q6PDI5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ecm29Q6PDI5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ecm29Q6PDI5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ecm29Q6PDI5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ecm29Q6PDI5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ecm29Q6PDI5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ecm29Q6PDI5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ecm29Q6PDI5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ecm29Q6PDI5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ecm29Q6PDI5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ecm29Q6PDI5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ecm29Q6PDI5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ecm29Q6PDI5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ecm29Q6PDI5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ecm29Q6PDI5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.5 ms