Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ttbk1Q6PCN3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ttbk1Q6PCN3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ttbk1Q6PCN3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ttbk1Q6PCN3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ttbk1Q6PCN3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Ttbk1Q6PCN3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Ttbk1Q6PCN3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ttbk1Q6PCN3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Ttbk1Q6PCN3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ttbk1Q6PCN3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ttbk1Q6PCN3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ttbk1Q6PCN3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ttbk1Q6PCN3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ttbk1Q6PCN3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ttbk1Q6PCN3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ttbk1Q6PCN3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ttbk1Q6PCN3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Ttbk1Q6PCN3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ttbk1Q6PCN3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ttbk1Q6PCN3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Ttbk1Q6PCN3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ttbk1Q6PCN3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Ttbk1Q6PCN3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Ttbk1Q6PCN3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Ttbk1Q6PCN3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Ttbk1Q6PCN3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ttbk1Q6PCN3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Ttbk1Q6PCN3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ttbk1Q6PCN3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ttbk1Q6PCN3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ttbk1Q6PCN3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ttbk1Q6PCN3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Ttbk1Q6PCN3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ttbk1Q6PCN3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ttbk1Q6PCN3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ttbk1Q6PCN3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ttbk1Q6PCN3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Ttbk1Q6PCN3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ttbk1Q6PCN3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Ttbk1Q6PCN3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Ttbk1Q6PCN3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ttbk1Q6PCN3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ttbk1Q6PCN3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ttbk1Q6PCN3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ttbk1Q6PCN3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ttbk1Q6PCN3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ttbk1Q6PCN3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ttbk1Q6PCN3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Ttbk1Q6PCN3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Ttbk1Q6PCN3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ttbk1Q6PCN3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ttbk1Q6PCN3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ttbk1Q6PCN3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ttbk1Q6PCN3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ttbk1Q6PCN3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ttbk1Q6PCN3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Ttbk1Q6PCN3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ttbk1Q6PCN3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Ttbk1Q6PCN3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ttbk1Q6PCN3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ttbk1Q6PCN3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ttbk1Q6PCN3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ttbk1Q6PCN3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ttbk1Q6PCN3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ttbk1Q6PCN3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ttbk1Q6PCN3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Ttbk1Q6PCN3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Ttbk1Q6PCN3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Ttbk1Q6PCN3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ttbk1Q6PCN3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ttbk1Q6PCN3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ttbk1Q6PCN3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ttbk1Q6PCN3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ttbk1Q6PCN3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Ttbk1Q6PCN3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ttbk1Q6PCN3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ttbk1Q6PCN3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ttbk1Q6PCN3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ttbk1Q6PCN3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ttbk1Q6PCN3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ttbk1Q6PCN3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ttbk1Q6PCN3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Ttbk1Q6PCN3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ttbk1Q6PCN3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.46
Ttbk1Q6PCN3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
Ttbk1Q6PCN3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ttbk1Q6PCN3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ttbk1Q6PCN3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ttbk1Q6PCN3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ttbk1Q6PCN3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ttbk1Q6PCN3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ttbk1Q6PCN3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ttbk1Q6PCN3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ttbk1Q6PCN3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ttbk1Q6PCN3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ttbk1Q6PCN3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ttbk1Q6PCN3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ttbk1Q6PCN3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ttbk1Q6PCN3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
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