Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp2d40Q6P8N9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp2d40Q6P8N9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp2d40Q6P8N9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp2d40Q6P8N9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp2d40Q6P8N9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp2d40Q6P8N9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp2d40Q6P8N9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp2d40Q6P8N9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp2d40Q6P8N9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp2d40Q6P8N9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp2d40Q6P8N9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp2d40Q6P8N9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp2d40Q6P8N9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp2d40Q6P8N9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp2d40Q6P8N9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp2d40Q6P8N9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp2d40Q6P8N9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp2d40Q6P8N9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp2d40Q6P8N9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp2d40Q6P8N9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp2d40Q6P8N9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp2d40Q6P8N9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp2d40Q6P8N9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp2d40Q6P8N9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp2d40Q6P8N9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp2d40Q6P8N9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp2d40Q6P8N9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp2d40Q6P8N9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp2d40Q6P8N9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp2d40Q6P8N9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp2d40Q6P8N9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp2d40Q6P8N9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp2d40Q6P8N9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp2d40Q6P8N9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp2d40Q6P8N9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp2d40Q6P8N9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2d40Q6P8N9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2d40Q6P8N9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2d40Q6P8N9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2d40Q6P8N9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2d40Q6P8N9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp2d40Q6P8N9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp2d40Q6P8N9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2d40Q6P8N9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2d40Q6P8N9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2d40Q6P8N9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2d40Q6P8N9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2d40Q6P8N9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2d40Q6P8N9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cyp2d40Q6P8N9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2d40Q6P8N9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2d40Q6P8N9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2d40Q6P8N9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2d40Q6P8N9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp2d40Q6P8N9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp2d40Q6P8N9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp2d40Q6P8N9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp2d40Q6P8N9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2d40Q6P8N9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2d40Q6P8N9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2d40Q6P8N9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2d40Q6P8N9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp2d40Q6P8N9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp2d40Q6P8N9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms