Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gga2Q6P5E6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gga2Q6P5E6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gga2Q6P5E6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gga2Q6P5E6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gga2Q6P5E6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gga2Q6P5E6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gga2Q6P5E6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gga2Q6P5E6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gga2Q6P5E6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gga2Q6P5E6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gga2Q6P5E6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gga2Q6P5E6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gga2Q6P5E6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gga2Q6P5E6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gga2Q6P5E6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gga2Q6P5E6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gga2Q6P5E6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gga2Q6P5E6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gga2Q6P5E6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gga2Q6P5E6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gga2Q6P5E6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gga2Q6P5E6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gga2Q6P5E6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gga2Q6P5E6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gga2Q6P5E6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gga2Q6P5E6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gga2Q6P5E6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gga2Q6P5E6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gga2Q6P5E6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gga2Q6P5E6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gga2Q6P5E6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gga2Q6P5E6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gga2Q6P5E6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gga2Q6P5E6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gga2Q6P5E6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gga2Q6P5E6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gga2Q6P5E6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gga2Q6P5E6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gga2Q6P5E6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gga2Q6P5E6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gga2Q6P5E6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gga2Q6P5E6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gga2Q6P5E6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gga2Q6P5E6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gga2Q6P5E6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gga2Q6P5E6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms