Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smchd1Q6P5D8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smchd1Q6P5D8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smchd1Q6P5D8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smchd1Q6P5D8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smchd1Q6P5D8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smchd1Q6P5D8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Smchd1Q6P5D8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smchd1Q6P5D8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smchd1Q6P5D8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smchd1Q6P5D8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Smchd1Q6P5D8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smchd1Q6P5D8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smchd1Q6P5D8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smchd1Q6P5D8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smchd1Q6P5D8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smchd1Q6P5D8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smchd1Q6P5D8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smchd1Q6P5D8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smchd1Q6P5D8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Smchd1Q6P5D8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smchd1Q6P5D8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smchd1Q6P5D8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smchd1Q6P5D8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smchd1Q6P5D8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smchd1Q6P5D8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Smchd1Q6P5D8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smchd1Q6P5D8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smchd1Q6P5D8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smchd1Q6P5D8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smchd1Q6P5D8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smchd1Q6P5D8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smchd1Q6P5D8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smchd1Q6P5D8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smchd1Q6P5D8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smchd1Q6P5D8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smchd1Q6P5D8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smchd1Q6P5D8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smchd1Q6P5D8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smchd1Q6P5D8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smchd1Q6P5D8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smchd1Q6P5D8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Smchd1Q6P5D8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Smchd1Q6P5D8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smchd1Q6P5D8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smchd1Q6P5D8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Smchd1Q6P5D8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smchd1Q6P5D8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smchd1Q6P5D8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smchd1Q6P5D8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smchd1Q6P5D8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smchd1Q6P5D8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smchd1Q6P5D8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smchd1Q6P5D8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Smchd1Q6P5D8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smchd1Q6P5D8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Smchd1Q6P5D8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Smchd1Q6P5D8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smchd1Q6P5D8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Smchd1Q6P5D8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smchd1Q6P5D8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smchd1Q6P5D8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smchd1Q6P5D8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Smchd1Q6P5D8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smchd1Q6P5D8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smchd1Q6P5D8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smchd1Q6P5D8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smchd1Q6P5D8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smchd1Q6P5D8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smchd1Q6P5D8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smchd1Q6P5D8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smchd1Q6P5D8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smchd1Q6P5D8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smchd1Q6P5D8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smchd1Q6P5D8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smchd1Q6P5D8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smchd1Q6P5D8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smchd1Q6P5D8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smchd1Q6P5D8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
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